简介：rRNA基因内转录间隔区序列分析技术已越来越多地应用于植物性中药材的品质鉴定中,窦红涛［13］将rDNAITS序列分析用于快速鉴定临床常见的镰刀菌,等．花椒及其混淆品的rDNAITS区序列分析与鉴别［J］.药学学报

简介：人的耳朵是为正常通讯的听觉的一台精细的感觉仪器，并且它的合适的工作高度依赖于mitochondrialoxidativephosphorylation。为nonsyndromic和aminoglycoside-inducedhearing损失的第一mitochondrial点突变在1993被识别。从那以后，很多个继承mitochondrial变化在听见损失被含有。大多数为联系mitochondrialdisorder的听觉损失负责的分子的缺点是在12SrRNA基因和tRNA基因的变化。在这评论，在对正常听觉机制和mitochondrial的短描述以后，我们构画出在联系聋的mitochondrialmutations的鉴定被做了的最近的进展，并且讨论mitochondrial机能障碍怎么贡献听觉损失。

简介：目的了解安徽农村地区散养家畜自然感染嗜吞噬细胞无形体状况和基因特征。方法应用巢式PCR对怀远、明光和广德县采集的148份家畜全血样本进行嗜吞噬无形体16SrRNA基因检测,并对扩增产物测序,应用生物软件MEGA4.0进行序列分析。结果148份家畜全血样本中检测出山羊、牛和犬嗜吞噬细胞无形体16SrRNA基因阳性率分别22.1%、25.0%和40.0%。26份PCR阳性扩增产物测序成功,序列分析结果表明：检出序列可归为4群,I群优势株占分析序列的66.7%,与北京、浙江和湖北等地检测序列同属一个分支。目的基因测定序列与参考序列同源性达97.0~99.0%。结论安徽调查地区农村家畜动物存在嗜吞噬细胞无形体感染,山羊是该地区嗜吞噬细胞无形体的重要宿主动物之一。

简介：【背景】米尔顿姬小蜂是一种入侵我国台湾地区的植食性小蜂,能够严重影响水果的产量和食用价值。目前在我国大陆没有分布,由于其个体微小,与近似种区别较小,通过传统的形态学分类方法难以鉴定,因此有必要研究其基因片段序列,探讨分子鉴定方法。【方法】利用PCR方法扩增并测定了米尔顿姬小蜂线粒体16SrRNA和COⅠ基因的部分序列,并对各序列的碱基组成进行了分析。然后根据COⅠ基因部分序列,利用DNAMAN的MaximumLikelihood方法构建了米尔顿姬小蜂与膜翅目其他科的系统发育树。【结果】16SrRNA基因的PCR扩增产物为426bp,COⅠ基因的PCR扩增产物为488bp。通过测序获得米尔顿姬小蜂16SrRNA和COⅠ基因部分序列,序列分析表明,16SrRNA和COⅠ基因的A+T含量均较高,存在较强的A+T偏向性。系统发育树显示,米尔顿姬小蜂与蚜小蜂科的Encarsiaberlesei亲缘关系最近,与姬小蜂科的Chrysocharisnautius、C.eurynota亲缘关系较远。【结论与意义】本研究为米尔顿姬小蜂的分子鉴定提供了依据。

简介：摘要目的研究成年寻常型银屑病患者和健康人群之间肠道微生物的差异。方法采集2017年9月至2018年2月于中国医学科学院皮肤病医院确诊的22例寻常型银屑病患者和23例健康对照者粪便样本，提取肠道菌群总DNA扩增，并采用二代16S rRNA基因靶向测序技术测序，分析菌群多样性及菌群分布。对照Silva数据库进行物种注释及分类，采用秩和检验分析各层级样本物种差异；采用QIIME软件（Version 1.9.1）计算OTU数目及α多样性主要指数（Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数），t检验分析指数差异；PCoA分析反映样本β多样性差异，置换多元方差分析两组群落组成结构差异；秩和检验及LEfSe分析评估物种差异。结果银屑病组OTU数目（147.55 ± 57.07）与健康对照组（148.96 ± 50.45）比较，差异无统计学意义（t = 0.088，P = 0.930）。银屑病组Shannon指数（4.08 ± 0.80）、Chao1指数（169.52 ± 63.17）、Simpson指数（0.87 ± 0.07）与健康对照组（分别为4.11 ± 0.94、175.36 ± 53.59、0.86 ± 0.90）比较，差异均无统计学意义（t = 0.12、0.34、0.27，均P > 0.05）。PCoA分析银屑病组与健康对照组的第一主成分差异为49.8%，第二主成分差异为15.62%，置换多元方差分析显示两组间β多样性差异有统计学意义（P = 0.011）。银屑病组与健康对照组有差异的菌群包括在银屑病组中显著升高的厚壁菌门、梭菌纲、梭菌目，丹毒丝菌目、丹毒丝菌科，健康对照组中显著升高的艾普西隆变形杆菌纲、弯曲杆菌目、弯曲杆菌科、弯曲杆菌属，拟杆菌目、拟杆菌科。结论寻常型银屑病患者与健康人的肠道菌群存在一定差异，肠道菌群有可能成为寻常型银屑病的潜在生物标志物。

简介：摘要：微生物研究从人工分离培养开始，但是，大部分微生物无法在实验室条件下生存，这对微生物多样性研究产生直接的影响。基于此，在高通量 DNA测序技术的应用下，以 16S rRNA和宏基因组高通量测序为基础，对微生物多样性展开研究，并以水体微生物、人体舌苔微生物（变量为是否有胃病）对比为研究对象，旨在实现 16S rRNA和宏基因组高通量测序在微生物多样性研究中的应用效果提升。

简介：摘要目的基于16S rRNA基因测序技术分析成人隐匿性自身免疫糖尿病（LADA）患者肠道菌群的特征。方法本研究为病例对照研究。选取2019年9月到2020年10月就诊于山西省长治医学院附属和济医院内分泌科的LADA及2型糖尿病（T2DM）患者作为研究对象，并从该院体检中心同期体检的人群中选取健康人群作为正常对照（NCP）者。收集研究对象谷氨酸脱羧酶抗体（GADA）、蛋白酪氨酸磷酸酶2抗体（IA-2A）等，收集研究对象粪便16S rRNA基因序列。使用微生物组分析软件QIIME（version 1.8.0）分析反映肠道菌群丰富性和多样性的alpha多样性指标和反映组间结构相似性的Beta多样性指标，采用t检验或单因素方差分析、Mann‐Whitney U检验或Kruskal-Wallis H检验、χ2检验进行组间比较，基于PICRUST分析微生物功能基因和代谢预测途径的变化特征，采用Spearman相关性分析法分析肠道菌群与各生化及免疫指标的相关性。结果共纳入42例研究对象，NCP组14名，T2DM组14例，LADA组14例。3组间的alpha多样性指数差异均无统计学意义（P>0.05），Beta多样性差异有统计学意义（P<0.05）。与NCP组相比，LADA组的短链脂肪酸产生菌属如毛螺菌属（Lac_Lachnospira）、罗氏菌属（Lac_Roseburia）、瘤胃球菌属（毛螺菌科）［Lac（Ruminococcus）］均降低（P<0.05），与T2DM组相比，LADA组的瘤胃球菌属（毛螺菌科）降低（P<0.05）。与NCP组相比，LADA组的苯丙氨酸合成、初级胆汁酸生物合成、次级胆汁酸生物合成等代谢预测功能途径降低（P<0.05）。Spearman相关性分析结果显示，GADA抗体滴度与瘤胃球菌属（毛螺菌科）呈负相关（r=-0.44），与普雷沃菌属（r=0.38）、小类杆菌属（r=0.34）、瘤胃球菌属（瘤胃球菌科）（r=0.53）均呈正相关（均P<0.05）；IA-2A抗体滴度与巨球菌属呈正相关（r=0.13，P<0.05）。结论LADA患者存在较为特异的肠道微生物群结构，并伴随着短链脂肪酸产生菌属如毛螺菌属、罗氏菌属和瘤胃球菌属（毛螺菌科）的减少，以及苯丙氨酸合成、胆汁酸生物合成等重要的生物功能基因和代谢预测途径的降低。此外，LADA患者胰岛自身抗体与瘤胃球菌属（毛螺菌科）、普雷沃菌属和小类杆菌属等菌属具有相关性。

简介：摘要目的探讨肺炎支原体肺炎支气管肺泡灌洗液(BALF)中23S rRNA耐药基因阳性患儿的临床及支气管镜下特点，发现能够早期识别肺炎支原体耐药性的临床指标。方法回顾性分析中国医科大学附属盛京医院小儿呼吸内科2017年10月至2018年6月确诊为肺炎支原体肺炎的61例住院患儿的临床资料，对其进行纤维支气管镜检查，并留取BALF，检测BALF中23S rRNA V区基因的2063位点突变情况，分为耐药基因阳性组和耐药基因阴性组，比较不同组别患儿的临床表现、相关实验室数据、影像学资料、纤维支气管镜的镜下表现。采用t检验、秩和检验、χ2检验、Fisher′s确切概率法、多因素Logistic回归分析等统计学方法对数据进行分析。结果61例患儿中耐药基因阳性组38例(62.30%)，耐药基因阴性组23例(37.70%)。2组患儿性别及年龄差异均无统计学意义(均P>0.05)。耐药基因阳性患儿的住院天数及发热时间长于耐药基因阴性组，更容易出现难治性肺炎支原体肺炎(RMPP)及肺外并发症，差异有统计学意义(P<0.05)，低氧血症差异无统计学意义(P>0.05)。2组患儿白细胞(WBC)、C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、D-二聚体(D-D)、白细胞介素6(IL-6)比较差异均有统计学意义(均P<0.05)。除耐药基因阳性组WBC水平低于耐药基因阴性组，其余实验室检查结果耐药基因阳性组均高于耐药基因阴性组；血清乳酸脱氢酶(LDH)及BALF中IL-6水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。对几种有统计学意义的实验室指标进行Logistic回归分析，发现WBC识别耐药基因的敏感性更高，最佳临界值为8.55×109/L，D-D识别耐药基因的特异性更高，最佳临界值为523 μg/L。耐药基因阳性组中35例(92.11%)影像学表现为大面积肺实变/肺不张，耐药基因阴性组为13例(56.52%)，差异有统计学意义(P<0.05)。耐药基因阳性组主要表现为黏膜糜烂、坏死，痰栓/塑型性痰栓及支气管炎性狭窄[19例(50.00%)]，耐药基因阴性组以黏膜纵行皱襞、絮状及黏性分泌物表现为主[14例(60.88%)]，差异有统计学意义(P<0.05)。结论23S rRNA V区基因发生点突变与肺炎支原体肺炎患儿的临床特征密切相关，发生A2063G突变的患儿更容易发生RMPP及肺外并发症，影像学和支气管镜下表现更重。血液中WBC及D-D水平的高低对早期识别耐药性具有一定意义，耐药基因阳性的肺炎支原体肺炎引起的全身过度免疫炎症反应需要引起重视。

简介：摘要目的探索对细菌16S rRNA区域和真菌内源转录间隔区(ITS)二代测序技术(NGS)在肾移植受者泌尿系感染(UTI)病原微生物检测中的应用价值。方法收集2017年1月至2019年12月在南方医科大学附属南方医院就诊的90例肾移植受者UTI中段尿标本，对同一份样本分别进行NGS微生物检测和传统尿培养，比较两者病原学检测结果。结果90例样本中，有21例样本因培养出3种及以上微生物而考虑被污染；余69例样本中，16S rRNA基因测序结果阳性36例(52.17%)，尿细菌培养检测阳性25例(36.23%)，两者比较差异有统计学意义(P<0.05)；ITS基因测序结果阳性34例(49.28%)，尿真菌培养检测阳性4例(5.80%)，两者比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论对于肾移植受者UTI的中段尿样本，NGS技术较尿微生物培养有更高的细菌和真菌检出率。随着NGS检测费用的降低，传统尿培养和NGS微生物检测技术的结合可以提高病原微生物的检出率和准确性，更好地进行移植受者泌尿系感染的个体化治疗。

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简介：摘要目的探讨死亡人体胸肌组织中rRNA亚基的稳定性。方法在我司法鉴定中心选取30例死亡案例，尸体存放时间不超过1天，无明显尸体腐败征象。派专人负责记录尸体死亡时间、年龄、性别。在标本胸大肌取组织块，PBS清洗，RNAlater处理后，放入冰箱统一测定RNA的两类亚基18srRNA、28srRNA。结果18srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为（23.4±5.6、21.4±7.5、20.3±5.6、18.9±6.2），差异无统计学意义（P>0.05）；28srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为（22.9±8.3、21.3±6.4、20.2±7.4、19.4±6.7），差异无统计学意义（P>0.05）。结论本次研究认为胸肌组织中18srＲNA和28srＲNA亚基稳定性好，适于作为晚期死亡的推断的内参基因。

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简介：AbstractObjective:To characterize and compare the microbiome signature in the maternal, intrauterine, and fetal environments and the associated bacterial species in women who experienced preterm birth and term birth.Methods:A total of 140 women with singleton pregnancies were enrolled in this study. Among them, 31 experienced spontaneous preterm delivery (gestational age < 37 weeks), and 28 of them experienced vaginal delivery at term. Maternal peripheral blood, saliva, and vaginal discharge samples and fetal membrane, amniotic fluid, and cord blood samples were collected immediately after delivery under sterile conditions. DNA was isolated from the fetal membrane and umbilical cord blood samples, and the V3-V4 region of the bacterial 16S rRNA gene was sequenced. The sequence data were quality-filtered, chimera-checked, and organized into operational taxonomic units (OTUs) based on phylogeny. Principal coordinate analysis of beta diversity measures was used for visualization. The linear discriminant analysis effect size (LEfSe) algorithm and Wilcoxon test were used to differentiate the microbiomes found in the fetal membranes and cord blood in the cases of preterm birth.Results:OTU analysis based on the 16S rRNA gene showed similar microbiomes in the maternal peripheral blood, amniotic fluid, fetal membranes, and cord blood. However, the LEfSe algorithm revealed significantly different bacterial compositions in the fetal environment between the preterm and term groups, with some of the bacterial species originating from the maternal peripheral blood or saliva.Conclusions:The bacteria in the intrauterine and fetal environments may originate from other body sites through hematogenous transmission, and may cause the occurrence of preterm birth.

简介：AIMTocharacterizepunctualmutationsin23SrRNAgeneofclarithromycin-resistantHelicobacterpylori(H.pylori)anddeterminetheirassociationwiththerapeuticfailure.METHODSPCRproductsof23SrRNAgeneVdomainof74H.pyloriisolates;34resistanttoclarithromycin(29fromalow-riskgastriccancer(GC)population:Tumaco-Colombia,and5fromahigh-riskpopulation:Tuquerres-Colombia)and40fromasusceptiblepopulation(28fromTumacoand12fromTúquerres)weresequencedusingcapillaryelectrophoresis.TheconcordancebetweenmutationsofVdomain23SrRNAgeneofH.pyloriandtherapeuticfailurewasdeterminedusingtheKappacoefficientandMcNemar’stestwasperformedtodeterminetherelationshipbetweenH.pylorimutationsandclarithromycinresistance.RESULTS23SrRNAgenefromH.pyloriwasamplifiedin56/74isolates,ofwhich25wereresistanttoclarithromycin(20fromTumacoand5fromTúquerres,respectively).In17resistantisolates(13fromTumacoand4fromTúquerres)thefollowingmutationswerefound:A1593T1,A1653G2,C1770T,C1954T1,andG1827CinisolatesfromTumaco,andA2144GfromTúquerres.ThemutationsT2183C,A2144GandC2196TinH.pyloriisolatesresistanttoclarithromycinfromColombiaarereportedforthefirsttime.NoassociationbetweentheH.pylorimutationsandinvitroclarithromycinresistancewasfound.However,therapeuticfailureoferadicationtreatmentwasassociatedwithmutationsof23SrRNAgeneinclarithromycin-resistantH.pylori(κ=0.71).CONCLUSIONThetherapeuticfailureoferadicationtreatmentinthetwopopulationsfromColombiawasassociatedwithmutationsofthe23SrRNAgeneinclarithromycinresistantH.pylori.

简介：摘要：遗传学研究生物的遗传、变异及其规律；人类对遗传的研究从性状开始的，遗传因子的发现到证明遗传密码的存在并破译遗传密码的过程是人们认识遗传的物质基础并揭示遗传规律的过程，在此过程当中遗传基因这个抽象的概念在思维上和实质上逐渐接近染色体、DNA；然后科学家们证明基因是有遗传效应的DNA的片段，从此基因不再是抽象的概念，以后人们又发现性状的表达离不开蛋白质（酶）合成，于是科学家们推测并证明基因通过指导蛋白质的合成而控制生物的性状，于是最终孟德尔的假设得到了科学解释。人民对遗传学的研究是实质上揭示基因表达的过程，这是生物学史上的重大发现。

简介：有害海藻的花蕾最近在在全世界的聚光灯下面，因为他们海洋的环境，水产业，渔业以及公共健康上的否定影响。为原因的种类的快速、精确的鉴定和quantification的方法的发展为花蕾，技术基于分类探针在之中是赞成的themost的警告andmonitoring是必要的。在这研究，二有害水藻，即，最小的Prorocentrum和Kareniamikimotoi被考虑。两个的部分大子单元rDNA(D1-D2)种类是第一放大PCR的，克隆并且定序。获得的序列然后被介绍为基因执行排列分析特定的区域。为每种的三根各自的候选人探针被设计并且过去常由在杂交(鱼)测试的situ执行荧光屏蔽最佳的探查。结果证明探针Pmin0443和Kmik0602为P显示了最好的杂交。最小和K。mikimotoi分别地。两特定(分类)(Pmin0443和Kmik0602)并且控制探针(UniC0512和UniR0499)在我们的实验室与另外的microalgae被用于跨反应的测试。探针Pmin0443和Kmik0602是特定的并且能作为介绍进指向rRNA的技术的分类探针被服务，例如P的鱼，三明治杂交，和DNA-microarray试金。最小和K。mikimotoi以后。最后，有两探查的鱼分析在模仿的地样品上被执行。探针能专门有目标房间井的hybridize，和没有重要差别(p>0.05)在鱼和轻显微镜学(LM)决定的样品的房间密度被观察。都建议探针是特定的并且能为监视两有害水藻被介绍进鱼。

简介：

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简介：自然界的生物绚丽多彩,千姿百态。同样是人.同样是狗,同样是猫,他(它)们也是各不相同的。这些形形色色的生物,实际上是由五花八门的蛋白质构成的一个个“物体”。不同的蛋白质还行使着不同的

简介：目的比较HBVS基因与HCVC基因真核表达质粒融合基因免疫与联合基因免疫的效果，为HBV和HCV融合基因疫苗研究奠定基础。方法将同时含HBVS基因与HCVC基因的真核表达质粒SCpcDNA3.1、含HBVS基因真核表达质粒SpcDNA3.1、含HCVC基因真核表达质粒CpcDNA3．1分别免疫小鼠；将SpcDNA3.1+CpcDNA3.1联合免疫小鼠。ELISA法检测血清抗HBs和抗HCV。结果无论是抗HBs和抗HCV阳转出现的时间、阳转率和体液免疫应答强度，融合基因免疫都优于联合基因免疫：融合基因免疫的抗HBs的应答强度低于SpcDNA3．1质粒的免疫，抗HBc的应答强度高于CpcDNA3.1质粒的免疫。结论HCVC基因或其表达产物对HBVS基因或抗原的表达和提呈有抑制作用；HCVC基因与HBVS基因相融合，更有利于HCV核心蛋白的提呈。