死亡人体胸肌组织中rRNA亚基的稳定性评价

(整期优先)网络出版时间:2014-12-22
/ 2

死亡人体胸肌组织中rRNA亚基的稳定性评价

王先亮1周渊1杨帆2林尤敏1

王先亮1周渊1杨帆2林尤敏1

(1.海南省陵水黎族自治县公安局;2.海南省安定县公安局)

【摘要】目的:探讨死亡人体胸肌组织中rRNA亚基的稳定性。方法:在我司法鉴定中心选取30例死亡案例,尸体存放时间不超过1天,无明显尸体腐败征象。派专人负责记录尸体死亡时间、年龄、性别。在标本胸大肌取组织块,PBS清洗,RNAlater处理后,放入冰箱统一测定RNA的两类亚基18srRNA、28srRNA。结果:18srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为(23.4±5.6、21.4±7.5、20.3±5.6、18.9±6.2),差异无统计学意义(P>0.05);28srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为(22.9±8.3、21.3±6.4、20.2±7.4、19.4±6.7),差异无统计学意义(P>0.05)。结论:本次研究认为胸肌组织中18srRNA和28srRNA亚基稳定性好,适于作为晚期死亡的推断的内参基因。

【关键词】18srRNA;28srRNA;胸肌组织

【中图分类号】R2【文献标号】A【文章编号】1671-8725(2014)12-0174-01

死亡时间的推断的准确是法医病理学的难点问题。随着RT-PCR技术的成熟,可以利用RNA高的稳定性的特点,进行死亡时间推断。荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)不仅避免以往技术手段中人为因素的干扰。我们希望通过荧光定量法检测rRNA的亚基在死亡人体胸大肌组织中的表达的稳定性。

1材料与方法

1.1材料来源

在我司法鉴定中心选取30例死亡案例,尸体存放时间不超过1天,无明显尸体腐败征象。派专人负责记录尸体死亡时间、年龄、性别。在标本胸大肌取组织块,PBS清洗,RNAlater处理后,放入冰箱统一测定。

1.3研究方法

1.4.1主要试剂与仪器

RNAStabilizationReagent(供应商:上海阿联科贸有限公司郑州办事处,产品产地:USA-Ambion),人工气候箱(供应商:嘉兴市中新医疗仪器有限公司),SV总RNA纯化系统(供应商:普洛麦格(北京)生物技术有限公司),HPSPR-8000生物分析仪(供应商:上海纳优仪器仪表有限公司),rRNA反转录试剂盒(供应商:上海研卉生物科技有限公司),紫外分析仪(供应商:上海驰唐电子有限公司),PCR仪器(上海市中山大学达安基因股份有限公司生产)、垂直电泳槽及电泳仪(上海精密仪器有限公司)、凝胶成像仪(武汉广美有限公司公司)、TICK400-测序仪(美国贝利马克有限公司)、日本岛津UV265紫外分光仪。

1.4.4RNA提取

收集统一保存的胸大肌组织块,采用盐析法提取基因组RNA。

1.4.5PCR扩增

使用40μl反应体系,PCR缓冲液,NaCl为2.0mmol/L,1μmol/L上下游引物,0.2mmol/LdNTP,TaqRNA聚合酶0.8U。循环参数如下:5分钟94℃预变性,退火20秒,72℃延伸20秒,循环40次。从基因组RNA中扩增MEF2A基因的外显子。

1.4.6SSCP分析

8μlPCR扩增产物和2μl缓冲液混合,先96℃加热10分钟后立即冰浴,上样于聚丙烯酰胺凝胶,240V电泳3小时,银染。

1.4.7rRNA的亚基

PCR产物全部上样琼脂糖凝胶,用E·EZNA胶回收试剂纯化产物。PCR正向、反向引物扩增,进行核苷酸序列测定,最终数据用RNA分析软件比对,并用Chromas软件测定RNA的两类亚基18srRNA、28srRNA。

1.5统计分析方法

将资料录入SPSS18.0软件。所有计量资料符合正态分布,采用均数±标准差(x±s)描述,两组均数的比较使用t检验。当P小于0.05时,判断有统计学意义。

2结果

2.130例标本在不同时间18srRNA、28srRNA亚基Ct值的变化18srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为(23.4±5.6、21.4±7.5、20.3±5.6、18.9±6.2),差异无统计学意义(P>0.05);28srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为(22.9±8.3、21.3±6.4、20.2±7.4、19.4±6.7),差异无统计学意义(P>0.05),见表1。

3讨论

随着分子生物学的发展,利用核酸降解推断死后经过时间已成为较好方法。但文献对RNA的报道很少,较好的报道也仅侧重于mRNA。因rRNA合成独立于mRNA,且rRNA表达高于mRNA,受RNA降解影响小。因此我们采用RT-PCR技术,观察胸肌中rRNA的稳定性。

本次研究发现18srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为(23.4±5.6、21.4±7.5、20.3±5.6、18.9±6.2),差异无统计学意义(P>0.05);28srRNA亚基在24小时、48小时、96小时、168小时的Ct值分别为(22.9±8.3、21.3±6.4、20.2±7.4、19.4±6.7),差异无统计学意义(P>0.05)。即胸肌中rRNA稳定性好。但是尸体不同组织中RNA的稳定性受诸多因素影响,而以胸肌含水量低最为稳定。

同样有学者[1]报道室温检测胸肌,18srRNA和28srRNA的含量在3小时内无明显改变。对于动物实验中也同样有学者使用凝胶图分析大鼠脑组织中18srRNA降解缓慢,直到死后7d仍无显著性降解[2]。

综上所述,胸肌组织中18srRNA和28srRNA亚基稳定性好,适于作为晚期死亡的推断的内参基因。

参考文献

[1]张萍,马开军,张恒等.实时RT-PCR常用内对照在死亡早期人心肌内的稳定性[J].法医学杂志,2012,28(2):81-84.

[2]李文灿,马端,张萍等大鼠心肌组织中microRNA和18SrRNA的降解与死亡时间的相关性[J].法医学杂志,2010,26(6):413-417.