简介：摘要目的探讨恶性胸膜间皮瘤（MPM）组织的Ⅰ型胶原蛋白α1链（COL1A1）和Ⅰ型胶原蛋白α2链（COL1A2）基因的表达水平及临床意义。方法于2020年1月，收集26例MPM患者的MPM组织及相邻的正常胸膜组织，采用定量反转录PCR测定组织中COL1A1和COL1A2基因表达水平，并采用受试者工作特征（ROC）曲线评估两者诊断MPM的效能。通过肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库分析COL1A1和COL1A2基因表达与临床病理特征的关系，采用基因表达谱动态分析两者表达水平与MPM患者总生存率（OS）和无疾病进展生存率（DFS）的关系，通过Cox比例风险回归模型探讨影响MPM患者预后的因素。采用TIMER 2.0平台探讨COL1A1和COL1A2基因在MPM中的表达与肿瘤免疫浸润性细胞的关系。结果与正常胸膜组织比较，MPM组织中COL1A1和COL1A2基因表达量明显增加（P<0.01），且两者表达呈正相关（P<0.001）；ROC曲线显示，COL1A1和COL1A2表达水平诊断MPM的曲线下面积分别为0.900和0.897。COL1A1基因表达量与MPM患者肿瘤类型有关（P<0.05），COL1A2基因表达量与MPM患者T分期有关（P<0.05）。COL1A1和COL1A2基因表达量与MPM患者OS均有关联（Logrank P<0.05），与DFS的关联均无统计学意义（Logrank P>0.05）。Cox多因素分析结果显示，COL1A1和COL1A2基因高表达及双相混合型MPM患者的死亡风险较高（P<0.05）。TIMER 2.0平台分析结果显示，COL1A1和COL1A2基因在MPM中的表达与巨噬细胞均呈正相关，COL1A2基因在MPM中的表达与中性粒细胞呈负相关（P<0.05）。结论COL1A1和COL1A2基因在MPM组织中高表达，对MPM的诊断、病情预测和预后评估有一定的价值，两者可能共同促进了MPM的发生发展。

简介：摘要目的分析5个成骨不全家系的COL1A1基因致病变异位点，为家系遗传咨询及产前诊断提供依据。方法应用高通量测序方法对5个成骨不全家系的先证者进行225个骨病相关基因进行检测分析，所检出的可疑变异经PCR扩增后进行Sanger测序，对5个家系的先证者及其家庭成员和100名正常个体进行验证，确定致病性变异后，对1个家系中的高危胎儿进行产前诊断。结果5个家系的先证者分别携带COL1A1基因c.3226G>A(p.Gly1076Ser)杂合错义变异、c.579delT(p.Gly194Valfs*71)移码变异、c.2911_2912insAG(p.Gly971Glufs*138)插入变异、c.3037G>A(p.Gly1013Arg)杂合错义变异，以及c.642＋5G>A杂合剪接变异；家系1胎儿产前诊断结果提示胎儿未携带与先证者相同的变异，与超声检查结果一致。5个家系的父母均未携带相应的变异，均为新发变异。100名正常个体均未检出上述变异。其中COL1A1基因c.3037G>A(p.Gly1013Arg)、c.2911_2912insAG(p.Gly971Glufs*138)变异为未报道的新变异。结论COL1A1基因变异是5个成骨不全家系的致病病因。本研究的结果丰富了COL1A1基因的变异谱，为家系遗传咨询和产前诊断提供了依据。

简介：目的发育性髋脱位（developmentaldislocationofthehip，DDH）的病因目前不明，但其与髋关节松弛密切相关。该研究通过比较DDH患儿与正常儿童关节囊中Ⅰ，Ⅲ型胶原在mRNA及蛋白水平的表达差异，以探索DDH患儿髋关节松弛的原因。方法选取性别相同年龄相近的9对发育性髋脱位患者及正常儿童配对比较。采用半定量RT-PCR及Western-Blot法检测COL1a1COL3a1在mRNA及蛋白水平的表达。图像分析软件进行量化分析，并经统计学处理。结果COL1a1在DDH组mRNA及蛋白水平表达均较正常对照组降低（P〈0．01）；COL3a1在DDH组mRNA水平表达较正常对照组降低（P〈0．01），其蛋白水平表达与正常对照组无显著差异（P〉0．05）。结论DDH患儿关节囊中Ⅰ型胶原在mRNA及蛋白水平表达较正常同性同龄儿降低，可能是导致DDH患儿髋关节松弛的原因。DDH患儿髋关节松弛可能与Ⅲ型胶原含量无关。

简介：AIM:TocomprehensivelyevaluatethepotentialassociationofCOL1A1polymorphismswithhighmyopiabyasystematicreviewandMeta-analysis.METHODS:AllassociationstudiesonCOL1A1andhighmyopiareporteduptoJune10,2014inPubMed,Embase,WebofScience,andtheChineseBiomedicalDatabasewereretrieved.Oddsratios(ORs)and95%confidenceintervals(95%CIs)wereanalyzedforsinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)usingfixed-andrandom-effectsmodelsaccordingtobetween-studyheterogeneity.PublicationbiasanalyseswereconductedbyEgger’stest.RESULTS:Atotaloffourstudiesfromreportedpaperswereincludedinthisanalysis.TheMeta-analysesforCOL1A1rs2075555,composedof2304highmyopiapatientsand2272controls,failedtodetectanysignificantassociationwithhighmyopia.Atotalof971casesand649controlsweretestedforCOL1A1rs2269336.TheassociationofCOL1A1rs2269336withhighmyopiawasobservedinrecessivemodel(CCvsCG+GG,P=0.03)andinheterozygousmodel(CGvsGG,P=0.04),butnotinothermodels.CONCLUSION:ThisMeta-analysisshowsthatCOL1A1rs2269336(CCvsCG+GG)affectsindividualsusceptibilitytohighmyopia,whereasthereisnoassociationdetectedbetweenSNPsrs2075555andhighmyopia.Giventhelimitedsamplesize,furtherinvestigationsincludingmoreethnicgroupsarerequiredtovalidatetheassociation.

简介：摘要：目的 探讨在膀胱癌中MiR-29b-3p靶向调节COL1A1的表达及临床意义。方法 利用Oncomine数据库对COL1A1在膀胱癌组织与正常组织、表浅性膀胱癌组织与浸润性膀胱癌组织中的表达进行差异分析;并使用cBioPortal数据库分析COL1A1与患者总体生存期的关系；TCGAportal数据库分析高表达与低表达COL1A1患者之间的生存曲线，了解预后情况，同时分析COL1A1基因表达水平与膀胱癌分期、膀胱癌分级的相关性。数据库预测microRNA并通过OncomiR数据库分析microRNA表达水平及与膀胱癌患者临床数据相关性。结果 COL1A1在膀胱癌中高表达，随着分级及分期的增加，COL1A1的表达量递增；生存分析显示，COL1A1高表达的膀胱癌患者预后不佳，生存时间缩短；通过数据库预测COL1A1上游miRNA MiR-29b-3P的证据最强；生存分析显示，MiR-29b-3P高表达的膀胱癌患者预后更佳，生存时间延长。结论 COL1A1在膀胱癌组织中呈高表达，其高表达患者预后较差，MiR-29b-3P高表达患者预后更佳，生信分析表明膀胱癌中MiR-29b-3p靶向调节COL1A1表达抑制膀胱癌进展，为进一步实验验证奠定研究基础，可能作为膀胱癌治疗靶点的潜力。

简介：摘要：目的：分析COL1A1在膀胱癌及癌旁组织中表达差异，研究COL1A1下调抑制膀胱癌细胞增殖和迁移的机制。方法：采用实时荧光定量 PCR检测 8例膀胱癌组织、癌旁组织和膀胱癌细胞系T24、UM-UC-3，以及人正常膀胱上皮细胞系SV-HUC-1中COL1A1 mRNA及预测miRNA表达水平；敲减COL1A1和阴性对照转染T24，通过 CCK-8、Transwell实验检测细胞的增殖、迁移水平；生物信息学预测COL1A1上游miRNA, miRNA-29b-3p mimic转染 T24细胞后实时荧光定量 PCR检测检COL1A1 mRNA表达水平；采用双荧光素酶实验验证miRNA-29b-3p和 COL1A1之间的关系。结果：与癌旁组织相比，COL1A1在膀胱癌组织中表达明显升高。COL1A1敲减后，明显抑制 T24增殖、迁移；生信预测miRNA-29b-3p与COL1A1靶向结合证据最强；与癌旁组织相比，miRNA-29b-3p在膀胱癌组织中表达明显降低，miRNA-29b-3p过表达之后，COL1A1 mRNA表达水平明显降低。双荧光素酶报告实验显示，miRNA-29b-3p靶向 COL1A1 mRNA的 3'非编码区。结论：相较于癌旁组织，COL1A1在膀胱癌组织中高表达，miRNA-29b-3p在膀胱癌组织中低表达；miRNA-29b-3p通过靶向下调COL1A1实现抑制膀胱癌进展，从而降低膀胱癌细胞的增殖、迁移。

简介：摘要目的对1例亲代表型正常但反复妊娠骨骼发育异常胎儿(可疑成骨不全)的家系进行遗传学分析，探讨胎儿的发病原因。方法对胎儿标本及亲代DNA进行全外显子组测序(whole exome sequencing, WES)，针对WES检测到的阳性位点进行Sanger测序验证。采集提取丈夫精液与单精子DNA，对致病位点进行PCR扩增并Sanger测序。结果WES检测到胎儿COL1A2基因c.1378G>A(p.G460S)杂合变异，为致病变异，夫妻双方外周血DNA均未检测到该变异。精液DNA检测到该位点野生型与变异型序列，在15个精子中有4个检测到该位点变异。结论为1例骨骼发育异常的胎儿明确了成骨不全的遗传学诊断。亲代的生殖腺嵌合是该家系反复妊娠骨骼发育异常胎儿的原因。在临床遗传咨询过程中，对于表型和和基因型均正常但反复生育或妊娠相同异常表型后代的案例，需要考虑到生殖腺嵌合的可能原因。

简介：目的研究长春市汉族人群I型胶原α1链基因（COL1A1）启动子区一1997G／T、＋1245G／T多态性及其与骨质疏松的关系。方法（1）抽取受试人群外周静脉血5ml，提取血清DNA。（2）应用实时荧光定量PCR仪扩增目的基因的DNA片段。（3）采用TaqMan探针法对-1997G／T及＋1245G／T位点进行等位基因鉴别。（4）应用双能x线骨密度仪测定骨密度（BMD），将374例受试人群分为骨密度正常、骨质疏松、骨质疏松性骨折3组。结果长春市汉族正常人群COL1A1—1997G／T转换中，GG基因型占38．40％，GT基因型占46．38％，TT基因型占15．22％，以GT基因型为主；骨质疏松患者女性GG等位基因型所占比例大于男性，GG基因型占44．39％，GT基因型占43．37％，TT基因型占12．24％；骨质疏松骨折患者GG基因型为主，占47．50％，GT基因型占35．00％，TT基因型占17．50％。骨质疏松组女性GG基因型BMD低于GT、TT基因型，但差异无统计学意义（P均〉0．05）；骨质疏松骨折组女性GG基因型BMD显著低于GT、TT基因型（P均〈0．05）。COL1A1＋1245位点G／T转换，在正常人群中发现GT杂合型2例，占总数的0．53％，其余均为GG基因型。结论COL1A1—1997G／T转换中正常人群以GT基因型为主，骨质疏松患者和骨质疏松骨折患者以GG基因型为主。骨质疏松患者和骨质疏松性骨折患者女性GG基因型BMD均低于GT、TT基因型。COL1A1—1997G／T与BMD显著相关，＋1245G／T与BMD无相关性。

简介：无

简介：无

简介：摘要采用二代测序技术对1例以牙本质发育不全为主要临床表现的Ⅲ型成骨不全患者及其父母进行致病基因鉴定，并对临床和遗传资料进行分析。测序结果显示，患者Ⅲ型成骨不全相关基因COL1A2存在错义突变：c.1171G>A；p.Gly391Ser，家系鉴定结果显示该突变来自患者父亲。COL1A2基因突变（c.1171G>A；p.Gly391Ser）可能是以牙本质发育不全为主要临床表现的Ⅲ型成骨不全的致病因素之一。

简介：摘要本文报告了1例胎儿期反复出现多发脑实质出血合并囊性脑白质软化灶形成，生后脐血基因检测为COL4A1基因新发突变的胎儿。该胎儿胎龄25周时超声发现脑实质内及小脑半球多处新鲜出血灶，定期复查超声及神经系统MRI，可见反复多发脑实质出血伴出血后多发脑白质囊性软化灶形成。羊水染色体荧光原位杂交及染色体微阵列分析未见异常。该胎儿于胎龄37周+3剖宫产出生，生后1和5 min Apgar评分均为10分，但生后出现反复呼吸暂停。生后6 d神经系统MRI提示新发脑实质出血伴脑白质软化灶形成。生后90 d随访时，该患儿四肢肌张力仍偏低，此后失访。全外显子组测序提示患儿COL4A1基因c.4738G>A（NM_001845.4；p.G1580S）新发杂合突变，其父母均未携带。由本例认为，对颅内出血的胎儿进行产前诊断时，特别是对胎儿期反复出现脑实质出血伴有出血后脑白质软化形成者，应考虑COL4A1基因突变可能。明确此基因诊断有助于客观分析胎儿预后，指导分娩方式。

简介：目的总结1例COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症（OI）的临床特征及基因突变的特点,为胎儿产前咨询提供依据。方法对产检B超检查示OI可能的胎儿流产组织抽提DNA进行基因型分析,自行设计COL1A1和COL1A2所有外显子及剪接区域的引物。利用Sanger测序法对胎儿行COL1A1和COL1A2基因外显子及剪接区域的测序分析并行父母验证。依据人类基因突变数据库（HGMD）专业版,对COL1A2突变所致疾病临床表型行文献复习。结果胎儿的COL1A1和COL1A2基因均检测出变异位点。COL1A2基因检测到杂合突变（c.3142G〉T,p.Glu1048Cys）在寡核苷酸多态性数据库、HGMD及Ⅰ型胶原蛋白突变数据库均未见报道,结合胎儿父母验证为新发突变,对比公共数据库及在线预测软件预测该突变类型为致病突变。在HGMD专业版中搜索COL1A2,共检索到387个COL1A2致病突变,与21种疾病及其亚型相关。92%的突变引起OI或其亚型,还可引起Ehlers-Danlos综合征或其亚型。结合COL1A2突变所致疾病临床表型行文献复习,本文报告胎儿符合Ⅱ型OI。结论产前通过超声影像结合基因分型诊断胎儿为COL1A2基因新发突变（c.3142G〉T,p.Glu1048Cys）所致Ⅱ型OI;COL1A2基因编码蛋白长链双螺旋的400~480氨基酸及MLBR3区域中甘氨酸被天冬氨酸或谷氨酸替代,多导致严重表型的OI;本文为产前准确预测胎儿结局、指导临床决策提供依据。

简介：摘要目的对1个痒疹样营养不良型大疱性表皮松解症(dystrophic epidermolysis bullosa pruriginosa, DEB-Pr)家系进行基因检测，探讨其可能的致病原因，为临床诊断提供依据。方法应用二代皮肤靶向测序包检测基因变异，再用Sanger测序验证。对变异的致病性进行分析。结果2例患者COL7A1基因均存在c.4128delT(p.Pro1376fs)移码杂合变异和c.8234G>A(p.Arg2745Gln)错义杂合变异，两变异分别来自患者母亲和父亲。其中c.4128delT(p.Pro1376fs)变异为未报道的变异，参照美国医学遗传学与基因组学学会评级指南提示其为致病性变异(PVS1+PM2+PP4)，c.8234G>A(p.Arg2745Gln)变异为可能致病性变异(PM2+PM3+PP1+PP4)。结论COL7A1基因c.4128delT和c.8234G>A复合杂合变异可能为本家系的致病原因，基因检测结果扩展了COL7A1的基因变异谱。

简介：以油茶湘林4号为材料,通过RT-PCR和RACE的方法克隆出油茶磷酸转运子Pht1基因家族一个成员的全长cD-NA序列,命名为CoPht1;1（GenBank登录号：JX403969）,通过实时定量PCR的方法检测了不同磷浓度下该基因在根系中的表达水平。结果表明：CoPht1;1CDS长度为1626bp,编码542个氨基酸,与其他物种的Pht1氨基酸序列具有较高的相似性,其中与夹竹桃科长春花的Pht1相似性最高,达到88%;蛋白质二级结构和拓扑结构预测表明,CoPht1;1具有跨膜蛋白的主要特征,与其他物种的Pht1具有一致性;实时定量RT-PCR结果表明,油茶Pht1基因的表达受低磷诱导,并在受磷胁迫处理（P浓度为0.1mmol/L）15d时表达量最高。

简介：无

简介：无

简介：摘要目的分析4例隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）患儿基因突变与临床表型情况。方法收集4例RDEB患儿临床资料，提取患儿及其父母外周血DNA，使用先天性大疱性表皮松解症多基因芯片进行高通量测序，确定致病基因位点后，采用Sanger测序法进行双向验证。结果4例患儿基因检测均显示COL7A1基因复合杂合突变，共8个突变位点。例1为中度泛发型RDEB，存在父源c.7828C>T和母源c.448G>A突变；例2为中度泛发型，存在父源c.3625_3635del和母源c.2726_2728del突变；例3为局限型，存在父源突变c.682+1G>A和等位基因突变c.5532+1G>A，其父母外周血DNA未发现c.5532+1G>A突变；例4为重度泛发型，存在父源c.5196delC和母源c.500_501insAGGG突变。其中c.2726_2728del和c.5196delC突变既往未见报道。结论4例RDEB患儿均存在COL7A1基因复合杂合突变，可能为其致病原因。其中，双等位基因移码突变携带者的表型重于双等位基因剪切位点、错义和无义、移码和氨基酸缺失及插入组成的复合杂合突变携带者表型。

简介：无

简介：由于STR位点突变率较高，平均突变率为2．1×10^-3，用STR进行亲子鉴定时需慎重。我处在进行一例亲子鉴定时，检出1例CSF1P0基因座不符合亲子遗传关系，现报告如下。