简介:为了解香蕉NBS抗病基因的密码子使用特点,掌握其基因编码规律,以香蕉全基因组NBS基因的74条高置信蛋白编码信息为数据来源,借助CodonW等软件对蛋白质的每个氨基酸编码数据进行了统计分析。结果表明,G+C含量范围为32.8%~45.4%,共鉴定获得了GUC和UAC等8个最优密码子且全部以G或C结尾。中性绘图分析发现,大部分基因分布在对角线及其附近区域,ENC与GC3的关联分析显示大部分基因落在标准曲线附近,这些都表明密码子偏好性受到碱基突变影响较大。密码子各参数相关性分析表明,ENC和G3s、C3s的大小都呈显著负相关,在基因表达密码子使用时,更倾向于选择第三位碱基是G/C的同义密码子。本研究分析了香蕉全基因组NBS基因的密码子偏好性,为通过密码子优化来提高NBS基因在香蕉中的表达,对香蕉进行抗性改良具有十分重要的指导作用。
简介:菲律宾稻米研究所和STRIVE基金会的研究显示,该国大多数消费者有可能接受转基因稻米。研究所所长宣称多数农民渴望尝试新的水稻品种,希望藉此降低成本及害虫带来的损失。由菲国生技公司DA—BPO(theDABiotechnologyProgramOffice)提供经费的三合一稻研究,目前已有所进展。专家们认为2011年,菲律宾的转基因水稻将首次通过所有管控,展开商业推广。三合一稻的育种目标,不仅把β-胡萝卜素转入地方品种,还通过传统育种技术将抗水稻衰退杆状病毒及抗白叶枯病的基因一起转移到稻米中。三合一稻被视为转基因稻米是因其父母本之一的黄金米含有β-胡萝卜素,而β-胡萝卜素由其它植物的基因转殖进入。
简介:NBS类抗病基因是植物中最大的一类抗病基因。亚麻荠是一种新型能源及特用油料作物,抗病、虫、杂草及逆境能力极强。然而,有关其抗性分子机理鲜有报道。本研究采用NB-ARC标准结构域的HMM模型,对亚麻荠本地蛋白质数据库进行检索分析,在全基因组水平上鉴定NBS类抗病基因。结果表明亚麻荠基因组共有472个NBS类抗病基因,分布于17条染色体上,56%的基因成簇分布。所有串联重复基因也都以基因簇的形式出现,这表明串联重复有利于基因簇的形成。系统发生树分析显示TIR-NBS-LRR(TNL)和CC-NBS-LRR(CNL)两类亚家族的抗病基因可能在进化过程中遵循不同的进化路径,导致其在应对病原菌侵染时发挥不同的功能。本研究发现将为鉴定新的植物抗病基因和解析亚麻荠高抗病机制提供科学参考。
简介:本研究利用在固体培养基上长期保存的杂交鹅掌楸胚性愈伤为外植体,对杂交鹅掌楸进行了遗传转化的研究。对于影响转化效果的众多影响因素,本研究主要讨论了乙酰丁香酮、菌液浓度、侵染时间对杂交鹅掌楸转化结果的影响。试验结果表明,在预培养阶段,乙酰丁香酮的使用有利于转化效率的提高,最佳条件时浓度100mg/L,预培养4d。而在共培养阶段,乙酰丁香酮的使用和延长共培养时间并不能显著提高杂交鹅掌楸的遗传转化效率。同时,在侵染时,不同菌液浓度和不同侵染时间对转化结果的影响也无显著的差异。通过PCR检测经过筛选培养获得的阳性植株,初步验证了外源基因已经整合到杂交鹅掌楸基因组中。
简介:摘要:在基因技术不断发展的时代背景下,对生物携带的遗传信息进行编辑已经成为一种可实现的操作,在对生物遗传信息进行定向操控时,其操作的对象也逐渐由原本大范围的核酸酶、锌指核酸酶(Zinc Finger Ncleases,ZFNs)逐渐转变为细小的类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription-like Activator Effector Nu-cleases,TALENs),直至现阶段,已经可以实现的对CRISPR/Cas9(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats/CRISPR-AssociatedNuclease9,Cas9)进行相应的编辑操作。这种操作方式不仅更加简单,表现出的应用潜力也是巨大的,可以在极大程度上缩短水稻定向基因培育的时间成本。因此,将其应用到遗传育种领域的研究之中是十分具有潜力的。
简介:[摘要]目的:探讨肝炎病毒基因型与抗病毒治疗反应的关系,为个体化治疗提供依据。方法:根据HBV基因型分为A型、B型、C型和D型四组,每组33例。比较各组患者的一般资料、肝功能、HBV DNA水平、HBeAg血清转换率和HBsAg清除率。结果:A型组的HBeAg血清转换率和HBsAg清除率均显著高于其他三组(P<0.05),而C型组的这两项指标均显著低于其他三组(P<0.05)。结论:HBV基因型与CHB患者的抗病毒治疗反应有密切关系,A型患者的治疗反应最佳,C型患者的治疗反应最差,B型和D型患者的治疗反应相似。HBV基因型检测有助于指导CHB患者的个体化治疗。
简介:目的旨在研究来源于抗病毒基因HERC5的新型环状RNAhsa_circ_0001426的特征,并探索该环状RNA真核过表达载体的构建和鉴定。方法从反向剪切位点的验证、蛋白翻译的潜能、对RNaseR处理的抵抗性、在细胞内的胞质胞核分布情况四个方面来研究hsa_circ_0001426的特征。此外,还利用环状RNA克隆构建试剂盒来构建hsa_circ_0001426的过表达载体,并验证其表达效果。结果hsa_circ_0001426是由HERC5基因第18号外显子反向剪切至第12号外显子形成,其序列中包含一条可翻译318个氨基酸的开放阅读框,其抵抗RnaseR的处理,主要分布于细胞质。针对该环状RNA的过表达载体构建成功,其在转染HEK293T细胞后48h的表达量最高。结论首次成功分析了抗病毒基因HERC5的新型环状RNAhsa_circ_0001426的特征,并利用试剂盒首次成功构建了hsa_circ_0001426的真核过表达载体,并可在细胞中高效表达;为深入研究hsa_circ_0001426的特征和功能奠定基础,并进一步扩充了HERC5基因的相关研究。
简介:摘要直接抗病毒药物在大部分丙型肝炎(丙肝)患者,包括很多既往难治患者中均可达到较高的治愈率,使得丙肝消除成为可能。我国丙肝高危人群患病率远高于一般人群,因此针对不同高危人群特点制定消除计划的微消除策略或为更加实际可行的方式。目前在我国,部分高危或特殊人群的丙肝筛查已在临床受到重视,如透析患者、孕期妇女、乙型肝炎患者或人类免疫缺陷病毒感染者,但仍有其他丙肝高危人群因分布零散、首诊于非感染科且接诊医护人员对丙肝认识不足、或者属于社会边缘群体等原因而无法被常规筛查体系所识别,成为丙肝消除的盲点及难点。本文意在探讨这类特殊人群诊疗面临的挑战,以期为公共卫生工作者和临床医师,特别是非感染/肝病科医师开展丙肝筛查及诊疗工作提供参考。
简介:摘要直接抗病毒药物在大部分丙型肝炎(丙肝)患者,包括很多既往难治患者中均可达到较高的治愈率,使得丙肝消除成为可能。我国丙肝高危人群患病率远高于一般人群,因此针对不同高危人群特点制定消除计划的微消除策略或为更加实际可行的方式。目前在我国,部分高危或特殊人群的丙肝筛查已在临床受到重视,如透析患者、孕期妇女、乙型肝炎患者或人类免疫缺陷病毒感染者,但仍有其他丙肝高危人群因分布零散、首诊于非感染科且接诊医护人员对丙肝认识不足、或者属于社会边缘群体等原因而无法被常规筛查体系所识别,成为丙肝消除的盲点及难点。本文意在探讨这类特殊人群诊疗面临的挑战,以期为公共卫生工作者和临床医师,特别是非感染/肝病科医师开展丙肝筛查及诊疗工作提供参考。
简介:植物在其与病原物相互关系长期进化过程中,通过各种代谢途径在体内可以形成各种抵抗病原物有关的物质.这包括植物凝集素、富含羟脯氨酸的糖蛋白、胼胝质、类黄酮和萜类植保素、过氧化物酶、几丁质酶(chitinease)和1,3-β-葡聚糖酶、病程相关蛋白和水杨酸等等.寄主植物细胞壁在感染病原菌后的木质化作用-木质素含量的增加是寄主植物抗性反应的一种特性,为阻止病原菌的进一步侵染提供保护圈.苯丙氨酸解氨酶(PAL),肉桂酸-4-羟化酶(CA4H)和4-香豆酸-CoA联结酶(4CL)是苯丙烷代谢途径的关键酶.这三个酶的活性在植物体内的变化与植物的抗病性存在一定的联系.水杨酸的Mr小,适宜于植物韧皮部中的长距离传输,被认为是植物诱导抗性的信号分子.