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  • 简介:摘要近年来转录组测序(RNA-seq)技术的成熟和推广应用,为直接测序和鉴定各种可能发生的融合转录本提供了强大工具。随着大宗病例RNA-seq研究报道的增多,血液肿瘤中融合基因的真实图谱日渐清晰。文章结合第62届美国血液学会年会的报道对相关研究进展进行介绍。

  • 标签: 血液肿瘤 转录组 基因测序 融合基因
  • 简介:聚落景观历来是反映区域文化景观差异的重要标志。中国的传统聚落景观因受区域文化差异的影响,表现出异常丰富的区域景观特点。如果引入生物学的“基因图谱”概念,对各聚落景观区系开展深层次的“文化基因”分析,最终建立反映各个聚落景观区系演化过程和相互关联性的“景观基因图谱”,对文化地理学的理论建设,具有重要的科学意义。

  • 标签: 文化景观 文化基因 传统聚落 区系 景观图谱
  • 简介:摘要目的基于癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)计划数据库的胶质瘤标本信息,探讨较低级别胶质瘤标本中相对低表达的基因与患者预后的关系。方法在TCGA数据库中选取678例胶质瘤患者[包括低级别胶质瘤(LGG)患者512例,胶质瘤母细胞瘤(GBM)166例]的698例胶质瘤标本[包括LGG患者529例,GBM169例]以及5例正常脑组织,分析其基因表达水平数据以及患者的临床资料。用R软件分析筛选在肿瘤中低表达的基因,对其进行基因注释和基因功能富集分析,用STRING和蛋白交互作用分析(Cytoscape)软件构建蛋白相互作用网络,以R软件根据基因表达水平结合患者的临床资料进行生存分析。结果在正常脑组织和胶质瘤标本、LGG和GBM组织均低表达的基因为155个;蛋白互相作用关系中连通性值最大的前20位基因中,得到12个基因的功能富集数据,谷氨酸离子型受体NMDA可能为重要的肿瘤生长信号通路之一。生存分析结果显示,12个基因中有7个基因与患者的生存预后改善有关,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论基于TCGA挖掘数据是一种有效的探索肿瘤抑癌基因的生物信息手段;谷氨酸离子型受体(NMDA)家族可能与胶质瘤的生长和预后明显相关。

  • 标签: 胶质瘤 抑癌基因 预后
  • 简介:摘要:构建黑龙江省“非遗”音乐文化基因图谱,是非物质文化遗产可视化、系统化的有效传承方式,更是在新时代的文化事业和产业繁荣发展中进行创新性发展的源泉。将黑龙江省“非遗”音乐文化的文化基因分为主体基因、附着基因、混合基因3大部分,采用分层分析提取基因特点的方法,绘制基因结构示图,将基因结构示图整合,构建出完整的黑龙江省“非遗”音乐文化文化基因结构图谱模型。结果可以清晰看到黑龙江省“非遗”音乐文化文化基因特征,使黑龙江省“非遗”音乐文化在创新发展的过程中稳定传承主体基因,适度变异附着基因,进一步发展混合基因。创新融合发挥黑龙江省“非遗”音乐文化中文化基因的新魅力,成为具有社会主义新时代民族情怀和大众审美趣味消费新文化。

  • 标签: 黑龙江省“非遗”音乐文化 基因图谱 创新性发展
  • 简介:水稻作为世界上最重要的粮食作物之一,与其它谷类作物有重要的同线性关系,是禾谷类植物的模式植物.国际水稻基因组测试项目(IRGSP)最近报道了覆盖率为95%、由389Mb组成的水稻基因组序列,实际上包括所有的常染色质和两个完整的着丝粒.总共37544个非转座的与蛋白质编码有关的基因已被鉴定,水稻基因组的绝大部分一般可通过DNA斑点杂交和电子杂交进行锚定,基因组测序数据也可整合到水稻的物理图谱中,物理图谱和遗传图谱的比较能够再现完整的水稻基因组的物理距离和遗传距离之间的关系.经常发现有细胞器基因转移到核内染色体上,水稻高分辨率的物理图谱的整合将很大地促进整个基因组的测序.今后物理图谱将有助于一些重要农艺性状的基因进行图位克隆,将作为禾本科植物基因组比较分析的一个重要工具.

  • 标签: 水稻基因组 物理图谱 遗传图谱
  • 简介:巴西农研所对咖啡基因重组研究取得了重大成果。目前已完全弄清咖啡基因排列图,确认大部分的遗传基因的组成。研究课题的完成,使人为改变咖啡质量和增加生产力成为现实。科研人员认为,科研项目的成功,可以改变咖啡的价格、成本、质量和生产力,如可以通过基因重组控制生产,生产强香味、不含咖啡因的产品。确认咖啡的遗传图后,

  • 标签: 巴西农研所 咖啡豆 基因组图谱 遗传基因
  • 简介:人类基因组内充斥着可以追溯到几十万年前的死亡基因,也就是废弃的基因,相当于基因组中有一个满是坏掉和无用东西的阁楼。

  • 标签: 人类 基因 遗传 DNA
  • 简介:【摘要】目的:通过肿瘤基因图谱基因共同表达网络鉴定乳腺癌的关键基因。方法:利用肿瘤基因图谱(TCGA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)寻找乳腺癌的关键基因,并使用免疫组化或PCR对其进行验证,从而鉴定出该癌症新的生物标志物或潜在的治疗靶点。结果:从WGCNA中,我们发现了53个与乳腺癌转移相关的基因。其中,ACTB和DDX5基因在乳腺癌循环肿瘤细胞中表现出高表达,而DDX5在TCGA伴转移的乳腺癌样本中也有高表达。结论:ACTB和DDX5基因在乳腺癌循环肿瘤细胞中表现出高表达,可能为乳腺癌的关键基因

  • 标签: 肿瘤基因组图谱 加权基因共表达网络分析 乳腺肿瘤 数据挖掘 生物学肿瘤标记
  • 简介:【摘要】目的:通过肿瘤基因图谱基因共同表达网络鉴定乳腺癌的关键基因。方法:利用肿瘤基因图谱(TCGA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)寻找乳腺癌的关键基因,并使用免疫组化或PCR对其进行验证,从而鉴定出该癌症新的生物标志物或潜在的治疗靶点。结果:从WGCNA中,我们发现了53个与乳腺癌转移相关的基因。其中,ACTB和DDX5基因在乳腺癌循环肿瘤细胞中表现出高表达,而DDX5在TCGA伴转移的乳腺癌样本中也有高表达。结论:ACTB和DDX5基因在乳腺癌循环肿瘤细胞中表现出高表达,可能为乳腺癌的关键基因

  • 标签: 肿瘤基因组图谱 加权基因共表达网络分析 乳腺肿瘤 数据挖掘 生物学肿瘤标记
  • 简介:分子标记辅助选择育种已成为水稻分子育种的主要策略。明确目标基因在染色体上的物理图谱定位与功能标记的开发应用是开展分子标记辅助选择育种的前提条件。本研究对已报道的40个抗白叶枯病基因在染色体上的定位、分子标记详情进行了整理总结,并将31个水稻白叶枯病抗病基因在水稻基因组物理图谱上进行定位标注;此外,本研究还归纳xa5、xa13、Xa21、Xa27四个抗病基因的功能标记,新开发了抗性基因Xa10、Xa23的功能标记。本研究将给育种工作者更好地利用水稻抗白叶枯病基因与鉴定抗性材料提供便利。

  • 标签: 水稻 白叶枯病 抗病基因 物理图谱定位 功能标记
  • 简介:基因水稻能够提高产量、改善品质、满足不断增长的人口对粮食的需求、增加农民收入,代表了杂交水稻育种的方向。从转基因水稻的研究到转基因大米摆上我们的餐桌,中间必然要经过转基因大米人体试验的环节。目前,转基因大米的人体试验之所以引发全世界舆论的轩然大波在于两点:一是以现在的技术生产出来的转基因水稻,还具有安全的不确定性;二是转基因大米安全的不确定性引发的人体试验的伦理争议。转基因大米人体试验要得到伦理上的辩护,首先,要用新的转基因策略,如创制智能不育系等,使得转基因大米的安全性大大提高之后,再进行转基因大米的人体试验;第二,必需遵循转基因大米人体试验的伦理原则:个人知情同意原则、不伤害原则、公平分配利益与承担风险原则;最后,人体试验要严格依照相关管理程序提交申请,由特设的伦理审查委员会审议批准后才能进行。

  • 标签: 转基因技术 食品安全 人体试验
  • 简介:美国奎格·文特研究所和多伦多儿童医院以及加州大学的研究者日前公布了奎格·文特本人的基因组序列,这是世界上第一次公布单个个体二倍体的基因组序列,初步分析报告发表在最新一期的《PLOS生物学》上。

  • 标签: 基因组序列 世界首例 加州大学 儿童医院 PLOS 多伦多
  • 简介:2006年5月,据美国《华盛顿邮报》报道,波士顿市马萨诸塞州综合医院生物移植研究中心研制出了一种特殊的“基因变异”猪。如果人类患者移植了这种猪的心脏,肝脏或肾脏等器官,将不会对它们产生明显的排斥现象。

  • 标签: 转基因技术 种猪 心脏 《华盛顿邮报》 人体 马萨诸塞州
  • 作者:
  • 学科: 医药卫生 > 免疫学
  • 创建时间:2015-12-22
  • 出处:《医药前沿》 2015年第17期
  • 机构:研究人员发现,基因活动的季节性变化意味着免疫系统在冬天会令发炎情况加剧。这可能解释了为什么与发炎相关的疾病,例如心脏病和风湿性关节炎的症状到了冬天通常会恶化,而且为什么人们通常在夏天更健康。
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  • 简介:中国科学家即将成为全世界首个把CRISPR—Cas9基因编辑技术修饰的细胞注入人体的团队。由四川大学华西医院的肿瘤学家卢铀教授领导的团队,计划从8月份起在肺癌患者身上测试这种细胞。临床试验在7月6日获得了华西医院伦理委员会的批准。“这是一项激动人心的进步。”

  • 标签: 人体临床试验 中国科学家 编辑 基因 四川大学华西医院 医院伦理委员会
  • 简介:美国物理学家组织网近日报道,在一项新的伞基因组相关性研究中,一个国际科研团队对6.1万人的基因组进行比较,在其遗传代码中找到了42个与肝功能有关的区域,其中32个区域是首次得到确认。研究人员同时在这些区域“揪出”了69个与肝功能有关的基因,有望为肝病患者找到新疗法。研究发表在《自然·遗传学》杂志上。

  • 标签: 肝功能 基因组 物理学家 科研团队 研究人员 肝病患者