简介：摘要目的分析2021年1月北京市某区一起新冠肺炎聚集性疫情中新型冠状病毒（SARS-CoV-2）基因组特征及变异情况，为疫情防控和风险评估提供参考。方法收集此次疫情相关呼吸道样本和外环境样本26份，使用高通量测序对病毒全基因组进行测定分析，对基因组数据拼接整理后进行一致性分析、变异位点分析及系统发生分析。结果共测定获得SARS-CoV-2病毒全基因组序列26条。26条病毒基因组之间高度一致，与参考株基因组（NC_045512）相比，核苷酸序列一致性中位数为99.896%，氨基酸序列一致性中位数为99.733%。26例病毒属于GR分支，共存在33个核苷酸突变位点，分布在ORF1ab、S、ORF8和N基因上，对应27个氨基酸突变位点，包括S蛋白69-70位缺失、N501Y、D614G等。病毒具有近期英国变异株（VOC 202012/01）的关键特征，属于英国变异株的类似株。结论此次聚集性疫情为同一传播链，疫情病毒为境外输入的英国变异株的类似株。

简介：摘要目的掌握2021年北京市流感流行特征及乙型Victoria系（简称BV）流感病毒血凝素（hemagglutinin，HA）基因、抗原性变异情况，为北京市流感防控提供科学依据。方法对北京市2021年1—11月流感病原学监测结果进行统计分析，并随机抽取15株BV流感病毒，通过HA基因扩增测序，分析其基因变异和进化特征。结果研究期间共收集流感样病例样本16 097份，其中核酸检测阳性208份，经型别鉴定BV流感病毒205份（98.56%）、乙型Yamagata（简称BY）系流感病毒3份（1.44%）。15株BV流感病毒HA基因序列与疫苗株B/Washington/02/2019相比，核苷酸相似度为98.39%~98.75%，氨基酸相似度为97.86%~98.40%。基因进化分析显示15株BV流感病毒均分布于Clade1A.3a2分支，与疫苗株相比存在多位点变异。15株BV流感病毒有11个糖基化位点。1株（6.6%）为疫苗株的低反应株。结论2021年北京市监测到的流感病毒中BV流感病毒占绝对优势，其HA基因位点多处发生变异，提示对该亚型变异的持续监测至关重要，为制定流感防控策略提供科学依据。