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6 个结果
  • 简介:摘要目的了解2020年冬季青岛地区上呼吸道感染患者的人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)流行状况和基因分型特征。方法采集青岛地区101例上呼吸道感染患者的咽拭子样本,提取核酸,应用荧光定量PCR方法进行15种常见呼吸道病毒的检测。对检测出HRV阳性的样本,应用RT-PCR方法扩增HRV VP4/VP2区并测序,对测序所获得的序列进行系统进化树和同源性分析。结果101例上呼吸道感染患者样本中,涉及6种常见病毒。检出1种病毒感染的样本34例(34/101,33.66%),检出混合病毒感染的样本2例(2/101,1.98%)。其中HRV的检出率最高,为21.78%(22/101)。扩增出20条HRV VP4/VP2区序列,分别为HRV-A组16株和HRV-C组4株,共涉及14种血清型。结论鼻病毒是2020年冬季青岛地区上呼吸道感染患者主要的病毒性病原之一,且以A组HRV感染为主。

  • 标签: 人鼻病毒 上呼吸道感染 系统进化树
  • 简介:摘要目的青岛地区2020年儿童肺炎住院患者人鼻病毒(human rhinovims,HRV)的分离与鉴定,为儿童肺炎的预防提供科学数据。方法收集2020年儿童肺炎住院患者的咽拭子样本,共计98份。应用荧光定量RT-PCR方法进行常见呼吸道病毒筛查,鉴定出HRV阳性的样本接种于H1-HeLa细胞,观察细胞病变。荧光定量RT-PCR鉴定后,扩增HRV-VP4/VP2基因并测序,使用MEGA软件构建系统进化树和同源性分析。结果98例肺炎住院患儿咽拭子样本中HRV阳性11例。接种H1-HeLa细胞,两份样本出现典型的细胞病变。经荧光定量RT-PCR鉴定为HRV病毒。VP4/VP2基因测序结果显示,分离的2株毒株的血清型分别为HRV-A28和HRV-A58。HRV-A28分离株与2011年新加坡参考株、2017年突尼斯参考株和2017年肯尼亚的参考株遗传距离较近,同属一个小分支。HRV-A58分离株与2009澳大利亚、2011年委内瑞拉、2011蒙古和2014年的美国的参考株的遗传距离较近,同属一个小分支。结论本研究首次在青岛地区的儿童肺炎患者咽拭子中分离出HRV-A28和HRV-A58毒株。

  • 标签: 人鼻病毒 病毒分离 系统进化分析
  • 简介:摘要目的调查青岛市俄罗斯籍货轮进口冷冻海鲜的污染状况,分析其装卸工人感染的危险因素。方法对进口冷冻海鲜采用“两阶段、全覆盖、混采”的方法采集样本分析其污染情况,采用实时荧光定量RT-PCR法进行新型冠状病毒(新冠病毒)核酸检测;设计统一的调查问卷,对71名装卸工人开展电话调查。调查对象分为2组:报告2例新冠病毒无症状感染者的工作班组(A组工人,23名);未报告新冠病毒感染者的工作班组(B组工人,48名)。采用Epi Info7.2软件分析装卸工人新冠病毒感染的相关危险因素。结果俄罗斯籍货轮的装卸货物全部为进口冷冻海鲜,货物的新冠病毒核酸阳性率为11.53%(106/919)。A组工人装卸的进口冷冻海鲜中,新冠病毒核酸阳性率为14.29%(70/490),明显高于B组工人的8.39%(36/429)(χ2=7.79,P=0.01),且A组工人装卸的进口冷冻海鲜的新冠病毒载量明显高于B组(P<0.05),A组工人的个人防护和行为得分明显低于B组(P<0.05);装卸工人搬运过程有上厕所、吸烟、饭前未规范洗手的行为是新冠病毒感染的危险因素。结论该批俄罗斯进口冷冻海鲜存在新冠病毒污染,且污染分布不均匀,应加强进口冷链从业人员的职业个人防护及行为的监督和管理。建议海洋渔业部门建立从业人员及运输货物的“捕捞-运输-装卸”全程闭环监测管理体系。

  • 标签: 新型冠状病毒 进口 冷冻海鲜 污染
  • 简介:摘要目的分析2019年青岛市秋冬季节儿童肺炎病例中病原的流行病学特征和混合感染情况。方法对2019年8月至11月青岛市3家医院治疗的77例肺炎患儿为研究对象,采集咽拭子,核酸提取,采用单管多重PCR反应检测20种常见呼吸道病原体。结果77例肺炎患者中,白细胞偏高29例(38.10%);中性粒细胞偏高16例(20.77%);淋巴细胞偏高30例(38.96%);病原检出率为77.92%(60/77),肺炎支原体(MP)感染为59.74%(46/77),博卡病毒10.39%(8/77),腺病毒为7.79%(6/77),鼻/肠病毒为3.89%(3/77),副流感4型为3.89%(3/77),百日咳鲍特菌为3.89%(3/77),副流感2型为2.59%(2/77),冠状病毒NL63/HKU1为2.59%(2/77),冠状病毒OC43为2.59%(2/77),人偏肺病毒为1.29%(1/77),副流感3型为1.29%(1/77)。病毒感染24例,占比31.16%(24/77)。两种病原混合感染为18.18%。结论多种病原感染引起2019年秋冬季青岛儿童肺炎,其中肺炎支原体感染率较高,其次为常见病毒感染,混合感染的病例较高。

  • 标签: 儿童 肺炎 病原感染 流行病学
  • 简介:摘要目的了解2019年秋冬季青岛地区手足口病住院患者柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)流行情况及VP1区基因特征和种系进化关系。方法收集2019年秋冬季青岛地区手足口病住院患者104份咽拭子,使用肠道病毒通用RT-PCR筛选出阳性标本。再用肠道病毒VP1区的通用分型引物扩增阳性样本,扩增序列测序并进行BLAST比对。用CV-A6 VP1全长引物,扩增CV-A6阳性样本,扩增产物测序,通过DNAstar和MEGA软件进行核苷酸和氨基酸的同源性分析并构建系统发育树。结果104份咽拭子样本中,肠道病毒检测阳性60份,总体阳性率为57.7%,其中CV-A6阳性率26.9%(28/104),柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)阳性率30.8%(32/104)。对28份CV-A6阳性的样本进行VP1区全长扩增、测序并进行比对和同源性分析获得22株阳性序列,其核苷酸同源性为93.6%~99.9%,氨基酸同源性为98.0%~100%。系统进化分析表明22株CV-A6均属于D基因型中的D3亚型。结论引起2019年秋冬季青岛地区住院手足口病的病原体是CV-A6和CV-A16,CV-A6的流行株主要是D3亚型。

  • 标签: 手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒A组6型 基因特征
  • 简介:摘要目的比较4种戊型肝炎(戊肝)病毒(hepatitis E virus,HEV)IgM抗体诊断试剂盒在1起暴发疫情中的诊断性能。方法应用4种试剂检测一起戊肝暴发疫情中研究对象的急性期血清标本中的IgM抗体,并检测HEV RNA;进行统计学分析。结果MP、科华、万泰和贝尔公司试剂的HEV IgM抗体检出率分别为40.00%(108/270)、29.26%(79/270)、28.52%(77/270)和20.37%(55/270),一致率为78.52%(212/270);对HEV RNA阳性血清标本,MP、科华和万泰试剂的检测灵敏度均为66.67%(32/48),贝尔试剂灵敏度为58.33%(28/48);对急性戊肝临床诊断病例血清标本,MP、科华和万泰试剂检测灵敏度为69.81%(37/53),贝尔试剂灵敏度为60.38%(32/53);贝尔与科华、贝尔与万泰试剂对HEV RNA阳性或急性戊肝临床诊断病例血清标本的HEV IgM抗体检出率差异具有统计学意义(McNemar检验:P<0.05),而其他试剂的检出率之间差异无统计学意义(McNemar检验:P>0.05);对HEV RNA阴性或临床排除急性戊肝研究对象血清标本,科华与万泰试剂的HEV IgM抗体检测结果最为接近(McNemar检验:P>0.05),其余试剂之间检出情况差异较大(McNemar检验:P<0.05)。结论MP、科华和万泰HEV IgM抗体诊断试剂盒灵敏度较高,适合急性戊肝的早期血清学筛查;在戊肝暴发疫情中,应结合HEV IgM抗体和HEV RNA检测结果进行综合诊断。

  • 标签: 戊型肝炎 酶联免疫吸附试验 IgM 性能比较