肝癌基于m6A甲基化调节基因对肝癌分型及预后建模

(整期优先)网络出版时间:2022-12-13
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摘要目的基于m6A甲基化调节基因对肝癌进行聚类分型并构建模型评估预后风险。方法基于13个m6A甲基化调节基因在肝癌中的表达情况,使用一致性聚类分析对来自TCGA数据库的肝癌患者进行分型,并对所得亚型的功能和预后意义进行研究。进一步筛选标记基因构建风险预测模型,用于评估肝癌患者的预后。结果基于m6A甲基化调节基因进行分型所得到的2个亚组在肝癌患者预后方面差异具有统计学意义(P=0.048),并在预后较差的亚组中筛选得到了38个在肝癌中与m6A甲基化相关的预后标志物;利用单因素cox分析鉴定出2个与肝癌不良预后有关的m6A调节基因:YTHDF1和YTHDF2(风险比>1,P<0.05);通过Lasso回归构建了风险预测模型能够有效预测肝癌患者4年内的预后状态(4年和3年的曲线下面积分别为0.685、0.669),并使用来自亚洲肝癌患者的数据集对该模型进行了验证。结论此研究为基于m6A甲基化的肝癌诊断和治疗提供新思路,且风险预测模型可以用于评估肝癌患者的短期预后情况。