为了找出差异基因用于高油酸油菜育种，对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料（油酸含量分别为84．4％和56.2%）成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析。IlluminaHiseq，M2000测序得到8．09Gbcleanreads，组成52361个unigene，平均长度为659bp。比对公共数据库得到48911f93．41％）个氨基酸序列。鉴定出6414个在高油酸油菜和低油酸油菜中差异显著的基因，这些基因有1296个在高油酸油菜中上调表达（20．21％），5118个下调表达（79．79％），共有2043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930，Bna0104450和Bna0305890在高油酸油菜中上调表达，其余的下调表达。Bna0501620，Bna0391450和Bna0084310在高油酸油菜中的表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上，分别为4．48倍，4．21倍和2．26倍。这些新发现的差异基因可用于高油酸油菜分子育种研究。
