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  • 简介:MicroRNAs(miRNAs)areendogenouslyexpressednon-codingRNAsof20-24nucleotides,whichpost-transcriptionallyregulategeneexpressioninplantsandanimals.RecentlyithasbeenrecognizedthatmiRNAscompriseoneoftheabundantgenefamiliesinmulticellularspecies,andtheirregulatoryfunctionsinvariousbiologicalprocessesarewidelyspread.Therehasbeenasurgeintheresearchactivitiesinthisfieldinthepastfewyears.Fromtheverybeginning,computationalmethodshavebeenutilizedasindispensabletools,andmanydiscoverieshavebeenobtainedthroughcombinationofexperimentalandcomputationalapproaches.Inthisreview,bothbiologicalandcomputationalaspectsofmiRNAwillbediscussed.AbriefhistoryofthediscoveryofmiRNAanddiscussionofmicroarrayapplicationsinmiRNAresearcharealsoincluded.

  • 标签: 微型RNA 生物学 计算透视图 核苷 基因表达
  • 简介:目的:分析microRNA(miRNA)相关专利,为我国miRNA科学研究和决策提供一定的参考。方法:运用专利文献计量学方法,使用TDA软件和Excel程序,对DII数据库中收录的miRNA相关专利的年份、国别、专利家族分布、专利权人、发明人和Derwent手工码进行分析。结果:发现了miRNA相关专利的年份分布、主要国家或组织的专利家族分布、前十位专利权人分布、前十位发明人分布及所涉及的Derwent手工代码分布情况。结论:我国在相关专利数量上虽然处于相对领先地位,但与美国等国相比仍存在很大差距,同时miRNA相关专利的专利家族多局限于本国,未曾形成一种广泛的多国高度分布的专利家族形势,缺乏对专利主动运用以获取专利信息和竞争优势的意识。

  • 标签: MICRORNA DII数据库 专利分析
  • 简介:MicroRNAs(miRNAs)是他们在植物和动物的目标基因的重要post-transcriptional管理者。miRNAs通常长是20-24核苷酸。尽管有他们的不平常地小的尺寸,miRNA基因家庭的进化历史似乎类似于编码theirprotein对应物。与在动物染色体的小却丰富的miRNA家庭相对照,植物有少数但是更大的miRNA基因家庭。植物miRNA基因家庭的成员经常是高度类似的,建议经由双人脚踏车基因复制和部分复制事件的最近的扩大。尽管许多miRNA基因越过植物种类被保存,一样的基因家庭在不同种类在尺寸和genomic组织显著地变化,它可以在目标基因规定引起剂量效果和空间、时间的差别。在这评论,我们在理解植物miRNA基因家庭的进化总结当前的进步。

  • 标签: 植物 miRNA基因家族 演化 转录后调节 串联复制 片段复制
  • 简介:microRNA(miRNA)是在多种真核细胞和病毒中发现的一类内源性非编码单链RNA,长约22个核苷酸,在进化上具有高度的保守性。miRNA可以通过碱基互补与靶基因mRNA的特定位点结合,抑制该蛋白合成或诱导该mRNA降解,在生物体生长、发育和疾病发生等过程中发挥着重要的作用。我们简要叙述了miRNA的特点和作用机制,并对miRNA在基因表达调控、胚胎干细胞调控及免疫调节等方面的最新进展进行了综述

  • 标签: MICRORNA 基因表达 干细胞 免疫 疾病
  • 简介:microRNA(miRNA)是一类长度为19-25个核苷酸的非常保守的非编码小RNA分子,在真核生物体内通过与mRNA的3'非翻译区序列不完全互补结合促使mRNA降解或抑制翻译,从而在转录后水平调控基因表达。miRNA在生物体内参与了细胞增殖与凋亡、生长发育、代谢活化、DNA修复等一系列生物学过程,与多种疾病尤其是肿瘤的发生发展密切相关。对miRNA的功能研究已发展到其分子机制层面,大量集中于其靶基因的预测和鉴定及调控相关表观遗传因子,为疾病的诊断、治疗及预后提供了新的线索。我们就miRNA的合成、功能研究及miRNA在临床上的应用前景做简要综述。

  • 标签: MICRORNA 生物学过程 功能研究 临床应用
  • 简介:microRNA(miRNA)是一类内源性非编码的小RNA,广泛存在于病毒、植物和动物等生物体内。miRNA通过与目标mRNA互补配对,对基因进行转录后的表达调控,在生物体的发育、增殖、分化和凋亡等方面发挥重要的生理作用。最近的研究表明,miRNA与病毒介导的肿瘤之间存在密切关系,尤其在调控乙肝病毒介导的肝癌、人乳头瘤病毒介导的宫颈癌及EB病毒介导的鼻咽癌、淋巴瘤等肿瘤中发挥重要作用。在病毒导致肿瘤的发生与发展过程中,miRNA表达谱出现时间与空间上的改变,其表达调控成为近年来病毒致癌的研究热点。我们简要综述病毒致癌相关miRNA的研究进展。

  • 标签: MICRORNA 病毒 致癌
  • 简介:MicroRNAs(miRNAs)是一个家庭(2123nt)突然,规章的非编码的RNA处理了从长(70110nt)miRNA先锋(pre-miRNAs)。识别真、假的先锋在miRNAs的计算鉴定起一个重要作用。一些数字特征从先锋序列和他们的第二等的结构被提取了适合一些分类方法;然而,他们可以失去在序列和结构隐藏的一些有用地歧视的信息。在这研究,pre-miRNA序列和他们的第二等的结构直接被用来基于在二个序列之间的加权的Levenshtein距离构造一个指数的核。这个字符串内核然后为检测真、假的pre-miRNAs与支持向量机器(SVM)被相结合。在331上基于训练真、假的人的pre-miRNAs的样品,在SVM的2个关键参数被5褶层选择有不同5褶层分区的十字确认和格子搜索,和5条认识被执行。在16独立人士之中,测试从3人,8动物,2工厂,1个病毒,和2人工地假的人设定pre-miRNAs,我们的方法统计上在11个集合上超过以前的基于SVM的技术包括3人,7动物,和1假人的pre-miRNAs。特别地,有通常在以前的工作被排除的多重环的premiRNAs正确地与92.66%的精确性在这研究被识别。

  • 标签: 链内核 支持向量原理 MIRNAS 前体
  • 简介:植物荷尔蒙植物生长素在调整植物生长和开发起一个关键作用。最近的进展在植物生长素反应小径的理解被做了,首先由在Arabidopsis的植物生长素反应异种的描述。另外,microRNAs(miRNAs)被显示了是为正常植物开发和生理学重要的基因的批评管理者。然而,很少对在miRNAs并且在正常开发期间的神经质的发信号之间的可能的相互作用被知道。这里,我们显示出那ArabidopsismicroRNA,miR167,有一个互补序列到AUXIN反应FACTOR6(ARF6)和ARF8mRNAs的部分,能为ARF8,然而并非为ARF6引起抄本降级。我们报导35S::MIR167b的phenotypic描述转基因的线,和表演转基因的线有的那严重35S::MIR167barf6arf8的类似于那些的显型加倍异种。转基因的显型建议miR167可以镇压在翻译的水平的ARF6。我们证明转基因的植物在花的机关的所有四锭盘是有缺点的。在转基因的花,细丝是反常地短的,花药不能适当地释放花粉,并且花粉谷物没发芽。我们的结果提供在表明网络支持的基因表示和植物生长素的调停miRNA的规章的小径之间的一个重要连接种繁殖开发。

  • 标签: 植物 繁殖能力 RNA167 激素 生长
  • 简介:尽管有它对疟疾的功效,在Artemisiaannua的artemisinin的相对低的收益(0.01%-0.8%)是到这药的商品化的严肃的限制。由外长、内长的因素的artemisinin和它的规定的biosynthetic小径的更好的理解是必要的改进artemisinin产量。增加的证据证明了microRNAs(miRNAs)在各种各样的生物过程起多重作用。在这研究,我们对表示顺序标签(EST)从Arabidopsis和米饭使用了以前已知的miRNAsA的数据库。annua将在A寻找潜在的miRNAs和他们的目标。annua。六潜在的miRNAs的一个总数被预言,它属于miR414和miR1310家庭。而且,八潜在的目标基因在这种被识别。在他们之中,七基因编码在artemisinin生合成起重要作用的蛋白质,包括HMG-CoAreductase(HMGR),amorpha-4,11-dienesynthase(广告),farnesyl焦磷酸盐synthase(FPS)和细胞色素P450。另外,为通常认为的AINTEGUMENTA编码的基因,涉及信号transduction和开发,也作为目标之一被预言。这在silico学习是第一显示miRNAs指向编码涉及artemisinin生合成的酶的基因,它可以帮助在A理解artemisinin生合成的调停miRNA的规定。annua。

  • 标签: MICRORNA 青蒿素 HMG-COA还原酶 MRNA 生物合成途径 miRNAs
  • 简介:目的:设计靶向乙型肝炎病毒(HBV)基因保守区的人工microRNA(amiRNA),考察其对HBV基因表达的抑制作用。方法:比对HBV全基因组现有序列,选择保守区设计amiRNA,定向克隆到pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR载体,将amiRNA载体与HBV复制载体pHBV1.31共转染HepG2细胞,72h后收取细胞上清,ELISA检测HBV表面抗原(HBsAg)及e抗原(HBeAg)的含量,荧光定量PCR检测HBVDNA含量。结果:amiRNA可显著抑制细胞上清HBsAg、HBeAg和HBVDNA的水平。结论:amiRNA作为防治HBV感染的潜在有效手段之一值得进一步深入研究。

  • 标签: 乙型肝炎病毒 人工microRNA RNA干扰
  • 简介:microRNA(miRNA)对调控基因表达有着重要作用,病毒与宿主在miRNA水平存在着复杂的"对话"。研究显示,人类免疫缺陷病毒(HIV)可能编码病毒miRNA(vmiRNA),通过维持病毒潜伏、保护感染细胞免于凋亡或外力刺激下的细胞死亡等方式,在HIV病理过程中发挥重要作用。宿主miRNA则参与到了抗HIV的防御性机制中,但也面临HIV调控相应宿主miRNA、编码RNA沉默抑制物等多种阻力。深入研究HIV与宿主间miRNA水平上的动态相互作用,有助于进一步了解HIV的致病机理,开发新的治疗策略

  • 标签: MICRORNA 人类免疫缺陷病毒 病毒miRNA
  • 简介:目的探讨miR-134、CREB、pCREB在癫痫大鼠海马及难治性癫痫患者颞叶脑组织中的表达及意义。方法难治性癫痫患者及非癫痫对照组颞叶组织、氯化锂-匹罗卡品癫痫大鼠及空白对照组海马组织中,应用实时荧光定量PCR技术检测microRNA-134(miR-134)的表达,用Westernblot方法检测CREB及pCREB的表达,用免疫组织化学方法检测人脑颞叶皮质及大鼠海马区CREB、pCREB的表达。结果与对照组相比miR-134表达在难治性癫痫患者中明显降低(P〈0.05),在癫痫模型组中点燃后3、7、14、60d明显降低(P〈0.05),1d与30d表达降低较对照组差异无显著性(P〉0.05);癫痫模型组CREB在3、7、14、60d时间点明显升高(P〈0.05)、pCREB各时间点表达均高于空白对照组(P〈0.05)。结论难治性癫痫患者颞叶皮质及癫痫动物海马中miR-134表达下降,CREB、pCREB表达升高,提示其可能在癫痫发生发展机制中起重要作用。

  • 标签: miR-134 CREB PCREB 难治性癫痫 突触重塑
  • 简介:蜜蜂(Apismellifera)是有强壮的感觉能力和多样的行为的全部剧目的一只社会昆虫并且为学习学习和记忆的neurobiological基础作为一个好模型有机体被认出。在这研究,我们在microRNA(miRNA)和跟随用下一代的小RNA定序和介绍的Solexa/lllumina数字基因表示标签(DGE)的基于迷宫的视觉学习的送信人RNA(mRNA)分析了变化。为定序的小RNA,我们分别地从迷宫和控制组获得了13367770和13132655个干净标签。40差别的一个总数表示了已知的miRNAs在这二件样品之间被检测,并且所有他们在与控制组相比的迷宫组是起来调整的。为DGE,5681320和5939855个干净标签分别地从迷宫和控制组被检测。有388差别的一个总数表示了在这二件样品之间的基因,与起来调整的45基因和在迷宫组下面调整的343基因,与控制组相比。另外,10差别的表示层次表示了基因被量的反向的抄写聚合酶链反应(qRT-PCR)证实,他们中的八个的表示趋势与DGE结果一致,尽管变化的度在振幅是更低的。miRNA和mRNA表示的综合分析显示出那,在表示的40差别之中已知的miRNAs和388差别表示了基因,miRNA/mRNA的60pairs是在我们的现在的学习共同表示被识别。这些结果建议miRNA和mRNA可以在在蜜蜂学习和记忆的进程起一个枢轴的作用。我们的定序的数据为基于迷宫的视觉学习提供全面miRNA和基因表达式信息,它将便于蜜蜂学习和存储器的分子的机制的理解。

  • 标签: mRNA表达 学习模式 迷宫 蜜蜂 微RNA 可视化
  • 简介:目的:探讨微小核糖核酸145(microRNA-145)表达对宫颈癌Hela细胞增殖及凋亡的影响。方法:实验室常规培养宫颈癌Hela细胞并分为4组,空白(Blank)组(Hela细胞+lipMI1640)、microRNA-145组(Hela细胞+RPMI1640+microRNA-145-5pmimics)、阴性序列(NC)组(Hela细胞+RPMI1640+NC)、Mock组(Hela细胞+RPMI1640+Lipofectamine2000),记录各组Hela细胞转染率,采用实时荧光定量聚合酶链锁反应(QRT-PCR)检测各组Hela细胞中microRNA-145的表达水平,采用四甲基偶氮唑蓝(MTT)比色法检测Hela细胞增殖情况,采用4’,6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)染色法判断Hela细胞凋亡情况。结果:本研究中,各组Hela细胞转染率均〉80%;microRNA-145组microRNA-145的表达显著高于Blank组、NC组和Mock组,差异有统计学意义(P〈0.05)。转染24h、48h、72h后,microRNA-145组490nm波长处的光密度值(OD490值)较转染Oh后明显降低,转染48h、72h后,Blank组、NC组、Mock组OD490值较转染0h后时明显升高,转染24h、48h、72h后.microRNA-145组OD490值均低于Blank组、NC组、Mock组,差异有统计学意义(P〈0.05)。DAPI染色后,microRNA-145组Hela细胞凋亡率高于Blank组、NC组、Mock组,差异有统计学意义(P〈0.05)。转染后,Blank组、NC组、Mock纽的microRNA-145表达率、OD490值、DAPI染色后Hela细胞凋亡率比较差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论:microRNA-145表达上调可抑制宫颈癌Hela细胞增殖,并促进Hela细胞凋亡,通过药物调控microRNA-145表达有望成为宫颈癌治疗的新靶点。

  • 标签: 宫颈癌 微小核糖核酸145 HELA细胞 增殖 凋亡
  • 简介:目的探讨变应性真菌性鼻窦炎的诊断以及治疗方法。方法通过临床表现、皮肤激发试验、血清嗜酸性粒细胞、鼻腔真菌涂片、鼻窦CT、鼻内窥镜等专科检查,明确21例变应性真菌性鼻窦炎患者,给予丙酸氟替卡松鼻喷剂喷鼻、151服氯雷他定片10mg(1次/d)、生理海水鼻腔冲洗1~2次/d,治疗1周后,入院行鼻内窥镜鼻息肉切除鼻窦Fess手术,术中彻底清除病变鼻窦内真菌团块或褐色泥砂样真菌泥后,氟康唑氯化钠注射液冲洗窦腔,术后氟康唑氯化钠注射液冲洗清洁术腔,每周1~2次,连续1个月,鼻腔局部继用糖皮质激素3—6个月,获得良好的治疗效果。结果21例变应性真菌性鼻窦炎患者中,单侧鼻窦发病16例,占76.2%,双侧鼻窦发病5例,占23.8%,上颌窦发病16例,占76.2%,上颌窦合并筛窦发病4例,占19.0%,蝶窦发病1例,占4.8%,伴鼻息肉15例,占71.4%,伴有哮喘史8例,占38.1%,术后2例复发,占9.5%。结论变应性真菌性鼻窦炎临床诊断并不困难,治疗以手术为主,但术前糖皮质激素的应用,手术时机选择,术后对鼻腔与鼻窦变应反应的处理,将直接影响预后。

  • 标签: 变应性 真菌 鼻窦炎
  • 简介:MicroRNAs是否定地在post-transcriptional水平调制基因表示的短规章的RNA,并且深深地涉及癌症的几种类型的致病。调查特定的miRNAs和他们的目标基因是否参予喉的癌的分子的致病,oligonucleotidemicroarrays被用来与正常纸巾相比在喉的癌纸巾估计microRNAs和mRNAs的微分表示侧面。oncogenicmiRNA,microRNA-21(miR-21),被发现是在喉的癌纸巾的upregulated。由特定的antisenseoligonucleotides的miR-21击倒而miR-21的overexpression提高了细胞的生长活动,由殖民地形成试金检测了,禁止了HEp-2细胞的增长潜力。miR-21抑制引起的房间数字减小由于G1-S阶段转变的控制的损失,而不是apoptosis的显著增加。随后,miR-21的新目标基因,BTG2,被发现是在喉的癌纸巾的downregulated。BTG2被知道充当一个平底锅房间周期管理者和肿瘤suppressor。这些调查结果显示miR-21的那异常表情可以由维持BTG2的底层贡献喉的癌的恶意的显型。oncogenicmiR-21和它的目标基因的鉴定,BTG2,为癌症诊断和治疗在喉的癌是潜在地珍贵的。

  • 标签: 细胞周期调控 调控基因表达 和平号 喉癌 microRNA miRNAs
  • 简介:采用15%的PEG6000高渗溶液培养的方法,研究了21个绿豆品种的芽期抗旱性。结果表明:种子吸水速度快、萌发时间短、吸水率小、相对发芽势和发芽率高的品种,具有较强的抗旱性,并鉴定筛选出4份绿豆抗旱种质。

  • 标签: 绿豆 抗旱性 PEG6000 芽期
  • 简介:今年5月25日至5月26日,国家自然科学基金委员会在京举办了“21世纪科学前沿与中国的机遇”高层论坛会。国务委员陈至立出席开幕式并作重要讲话。中国科学院院士、国家自然科学基金委员会主任陈宜瑜在开幕式上致辞。包括李政道、丁肇中等7位诺贝尔奖获得者在内的国际科学大师,国内有关学科领域的科学家,以及美国、德国、日本、俄罗斯等7个国家科学基金组织的领导人共200余人出席论坛。

  • 标签: 中国科学院院士 科学前沿 21世纪 论坛会 国家自然科学基金委员会 高层