简介:摘要目的分析淮南市2016年度外环境标本中H7N9禽流感病毒基因组特征。方法采集活禽市场禽类粪便、笼具、台面或砧板、脱毛机、禽类饮水、污水等标本,选取H7N9、H9亚型PCR检测阳性标本(Ct值≤30),鸡胚分离培养后提取RNA,扩增8个基因节段进行基因序列测定、分子特征与进化分析。结果2016年150份淮南市外环境标本检出H7N9亚型46份、H9亚型71份、H5亚型38份;2份H7N9亚型分离成功。基因进化分析显示,淮南市2株H7N9禽流感毒株血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因均处于长三角分支内,其余6个内部基因无明显地域分布聚类;HA氨基酸受体位点出现G186V、Q226L位点变异,NA茎区缺失了"QISNT"序列,R294K、E119V耐药位点没有发生突变;聚合酶发生PA基因I550L,PB1基因I368V,PB2基因I504V突变;NS1基因出现增强致病力的位点N205S、P42S改变;耐药相关位点出现M1基因N30D、T215A,M2基因S31N突变。结论2016年淮南市活禽市场禽流感病毒高度流行,H7N9亚型感染人类的能力有所增强,M2离子通道抑制剂耐药,NA抑制剂仍为敏感有效药物。
简介:摘要目的分析甘肃省发现的人感染H9N2禽流感病毒分离株全基因组特征。方法对甘肃省2016年流感样病例中发现并确诊的1例人感染H9N2禽流感病毒病例进行病原学分析,并使用MEGA 7.0等软件解析该毒株全基因组特征。结果该毒株HA、NA、MP、NP、NS、PA、PB1和PB2各个基因片段与甘肃省2014-2019年外环境中分离获得的H9N2禽流感病毒各基因片段高度相似,且均>90%;其HA基因属于BJ/94-like支系,PB2和MP属于G1/97-like支系,PB1、PA、NS和NP基因属于F/98-like支系,MP和PB2与H7N9、H10N8和H5N6亲缘关系较近;氨基酸序列比对发现HA裂解位点呈PSRSSR↓GLF排列,发生H183N和Q226L突变,有7个HA糖基化位点;NA茎部62~64位均缺失ITE 3个氨基酸;M2-31N、NS1-42S、PA-356R和PA-409N突变。结论人感染H9N2禽流感病毒为偶发感染,但甘肃省外环境中分离的H9N2禽流感病毒具有一系列哺乳动物适应性分子标记,提示人群感染风险较高,需多部门加强监测,共同应对流感大流行。
简介:摘要目的了解四川省阿坝州大骨节病历史重病区内、外环境硒及T-2毒素水平。方法2018年7月至2019年2月,在阿坝州马尔康市、壤塘县、阿坝县、若尔盖县、红原县5个大骨节病历史重病区市(县),分别选择1个历史重病区乡,每个乡选择1个历史重病区村和1个非病区村。每个村采集30名常住6 ~ 12周岁儿童发样,检测发硒含量;每个村采集10户家庭主食粮样,检测粮食硒含量及T-2毒素含量;每个村采集10份土壤样,检测土壤硒含量。结果病区村和非病区村儿童发硒(n = 180、120)中位数分别为0.260 0、0.330 0 mg/kg,病区村低于非病区村(Z = - 6.319,P < 0.01);其中马尔康市和红原县病区村儿童发硒均低于非病区村(Z = - 3.327、- 4.939,P均< 0.01),壤塘县和若尔盖县病区村与非病区村间比较差异均无统计学意义(P均> 0.05)。病区村和非病区村粮食硒(n = 110、70)中位数分别为0.005 8、0.018 0 mg/kg,病区村低于非病区村(Z = - 2.263,P < 0.05);其中若尔盖县病区村粮食硒低于非病区村(Z = - 2.306,P < 0.05),马尔康市、壤塘县、红原县病区村与非病区村间比较差异均无统计学意义(P均> 0.05)。病区村和非病区村粮食(n = 103、65)T-2毒素含量均低于检出限(1 μg/kg)。病区村和非病区村土壤(n = 60、40)硒含量分别为(0.045 3 ± 0.021 5)、(0.065 8 ± 0.045 4)mg/kg,病区村低于非病区村(t = 2.672,P < 0.05);其中红原县病区村土壤硒低于非病区村(t = 14.838,P < 0.01),马尔康市、壤塘县、若尔盖县病区村与非病区村间比较差异均无统计学意义(P均> 0.05)。结论四川省阿坝州大骨节病历史重病区儿童发硒整体处于中等水平(0.25 ~ < 0.50 mg/kg),粮食、土壤硒整体处于缺乏水平(< 0.025、< 0.125 mg/kg),且病区村均低于非病区村;粮食中未检出T-2毒素。