简介：摘要本文通过国内外文献的阅读分析，对乙肝病毒基因型发现及发展，基因型分型测试主要方法，病毒基因的分布区域，变异与临床表现，做了简要综述。

简介：1丙型肝炎病毒(HCV)的基因结构HCV-1型病毒是单股正链RNA病毒,含有大约9400个核苷酸,在3'末端有一个"多肽A尾巴",核酸序列包含有由341个硷基组成的5'非翻译区,一个含3011个氨基酸的多肽蛋白的巨大的开放读码框架(Openreadingframe,ORF)和由约27个硷基组成的3'非翻译区.据推测,三种N-末端HCV蛋白(C.E1和E2/NS2)是结构蛋白,而四种C-末端蛋白(NS2,NS3,NS4和NS5)在病毒复制中起作用.每种HCV基因型的开放读码框架(ORF)的长度存在着特异性的差别,HCV-1型中ORF长度约9400个核苷酸,而HCV-2型中ORF长度是9099个核苷酸,HCV-3型长度是9063个核苷酸.

简介：乙型肝炎由乙型肝炎病毒（HBV）感染引起,呈全球性分布,我国是乙型肝炎的高发病地区。目前根据HBV的进化变异程度可分为9种基因型,不同基因型的流行病学、自然史以及与抗病毒治疗效果间的关系均有其特征性,HBV基因分型有重要的临床意义。因此,HBV基因型的研究已成为近年来国内外研究HBV的热点问题。

简介：摘要目的了解新疆地区丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布特征。方法选取2013年1月至2018年9月在新疆医科大学第一附属医院就诊的慢性HCV感染者6 462例，排除了重复检测者，有效纳入了检测HCV基因型者共4 773例，采用PCR-反向点杂交法，并回顾性分析基因型的分布。组间比较采用χ2检验或F检验，P < 0.05为差异有统计学意义。结果4 773例标本中检测出了5种基因型：1b型2 928例（占61.3%）、2a型1 241例（占26%）、3a型375例（占7.9%）、3b型205例（占4.3%），6a型24例（占0.5%）。患者年龄在（48.14±13.93）岁，各年龄段均以检出基因1b型为主；汉族2 965例，18个少数民族共1 808例，其中汉族和少数民族基因1b型分别为1 798例（占60.6%）、1 130例（占62.5%），基因3型分别为235例（占7.9%）、345例（占19.1%）。在少数民族中主要以维吾尔族居多，且可检测出基因6a型，其他民族未检测出6a型，检出基因1b型维吾尔族704例（占62.1%），基因3型维吾尔族共269例（占23.7%）。男性2 413例，女性2 360例，其中基因1b型男性1 418例（占58.8%）、女性1 510例（占64.0%）；基因3型男性424例（占17.6%），女性156例（占6.6%）。基因1b型与基因非1b型患者性别比例比较，差异有统计学意义（P < 0.05）；汉族与少数民族患者基因型2a、3a、3b、6a型的检出率比较，差异均有统计学意义（P值均< 0.05)。结论新疆地区HCV基因型分布呈多样性，以1b型为主。少数民族HCV基因3型较汉族比例高。新疆HCV基因型检测丰富了我国HCV基因型分布特征，并为患者个体化治疗提供依据。

简介：[摘要]目的：探讨肝炎病毒基因型与抗病毒治疗反应的关系，为个体化治疗提供依据。方法：根据HBV基因型分为A型、B型、C型和D型四组，每组33例。比较各组患者的一般资料、肝功能、HBV DNA水平、HBeAg血清转换率和HBsAg清除率。结果：A型组的HBeAg血清转换率和HBsAg清除率均显著高于其他三组（P<0.05），而C型组的这两项指标均显著低于其他三组（P<0.05）。结论：HBV基因型与CHB患者的抗病毒治疗反应有密切关系，A型患者的治疗反应最佳，C型患者的治疗反应最差，B型和D型患者的治疗反应相似。HBV基因型检测有助于指导CHB患者的个体化治疗。

简介：摘要目的对乙肝病毒基因型与临床相关性进行研究和分析。方法此次临床研究主要以我院在2012年3月份到2013年7月份收治的475例乙肝病毒感染患者为研究对象，对所有患者进行HBV基因型检测，并对基因型与临床相关性进行研究和分析。结果基因型一共分为C基因型、B基因型以及D混合基因型三种，其中C基因型有327例，B基因型有130例，D混合基因型有7例，不确定有11例。在性别上以及年龄上，基因分型差异存在统计学意义，P<0.05。在耐药性上，基因分型不存在统计学意义，P>0.05。结论在乙肝病毒感染者中，基因分型与性别和年龄存在一定联系，与耐药性则不存在关系。

简介：摘要目的探讨乙型肝炎患者的基因型与其临床表型的相关性。方法选择2013年1月到2015年3月期间在我院治疗的乙型肝炎病毒患者250例为研究对象，分析所有患者的乙型肝炎病毒基因型及其与临床表型的相关性。结果有63.2%患者的基因型为B基因型，36.8%患者为C基因型；B基因型患者的平均年龄为（29.2±9.4）岁，远小于C基因型患者（36.7±10.1）岁；C基因型在肝硬化患者和肝细胞癌患者中所占比例远高于在慢性乙型肝炎感染者和无症状病毒携带者中的比例；B基因型的HBeAg阳性率为55.7%，显著低于C基因型的72.8%；对比存在显著性差异（P<0.05）。结论乙型肝炎病毒基因型与患者的临床表型有很大的相关性，C基因型患者更容易发展成为严重的肝硬化或肝细胞癌，在临床诊断中要引起足够的重视。

简介：摘要目的分析福建省2014—2019年不同基因型麻疹野病毒流行情况，为制定后续麻疹防控策略，完成消除麻疹目标提供参考。方法收集福建省2014—2019年麻疹发病监测数据及各地市上送的麻疹疑似病例咽拭子样本，采用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹病毒N蛋白羧基端450个核苷酸序列，对扩增产物进行序列鉴定和分析。结果2014—2019年福建省共报告疑似麻疹病例1 102例，年发病率为0.47/10万；实验室共接收咽拭子标本884份，获得除疫苗株外麻疹病毒N蛋白羧基端450个核苷酸序列179条，其中110条为H1基因型麻疹毒株序列，43条为B3基因型麻疹毒株序列，26条为D8基因型麻疹毒株序列。福建省H1基因型麻疹病毒属于H1a基因亚型，存在两个分支，有19种不同的变异序列毒株，部分毒株与其他国家和地区的麻疹毒株高度同源(99.8%~100.0%)；福建省B3基因型麻疹病毒存在6个变异序列毒株，与国内外流行的B3型麻疹毒株之间核苷酸同源性为98.4%~100.0%，其中部分毒株与2018年的香港HongKong.C HN/35.18/B3毒株同源性为100.0%，与美国、日本、菲律宾等国的B3基因型毒株高度同源(99.8%)；而福建省D8基因型麻疹毒株存在5个变异序列毒株，部分毒株与2014年越南的HoChiMinh.VNM/11.14/MV95毒株、2019年日本的MVs/KobeC.JPN/28.19/19MR69毒株、2018年的泰国MVs/Samut_Sakhon.THA/8.18毒株高度同源。结论2014—2019年福建省共发现三种不同基因型别的麻疹野病毒(H1、B3、D8型)流行传播，其中H1a基因型依然是福建省的本土流行基因型，B3和D8基因型麻疹病毒为福建省输入性基因型毒株，并引起有限的传播流行。结果提示福建省近年来麻疹本土病例虽有所减少，但境外输入病例的风险在增大，后续应加强境外输入病例的监测。

简介：乙型肝炎在全球广泛分布,慢性乙型肝炎是导致肝硬化、肝功能衰竭和原发性肝癌的主要危险因素,我国是HBV感染的高流行区.随着近几年分子生物学的发展,对HBV基因型的研究更加深入,基因型与临床的关系日趋明确,不同的基因型对乙型肝炎的发病机制、血清学诊断和抗病毒治疗对策有一定的影响.

简介：

简介：目的了解镇江地区乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布及与临床的相关性。方法选择镇江地区HBV感染者257例，其中慢性HBV携带者49例，慢性乙型肝炎轻度52例、中度38例、重度32例，重型肝炎22例，肝硬化41例，原发性肝癌23例。应用聚合酶链反应（PCR）微板核酸杂交酶联免疫吸附（ELISA）技术检测HBV的基因型。结果257例HBV感染者中B基因型112例（43．6％），C基因型140例（54．5％），B＋C基因型5例（1．95％），未发现A、D、E、F、G和H基因型。C基因型在慢性乙型肝炎重度、重型肝炎、肝硬化、肝细胞癌中占绝对优势，分别占65．6％、72．7％、68．3％、78．3％，显著高于慢性HBV携带者的38．8％，P〈20．05。C基因型HBV感染者的血清丙氨酸氨基转移酶（ALT）水平（262．3±319．7u／L）、总胆红素（TBIL）水平（69．9±35．8μmol／1）、HBeAg阳性率（67．1‰）、HBVDNA定量中位数绝对值（6．02±1．34）显著高于B基因型（141．5±206．1u／L）、（38．3±22．4μmol/l）、46．4％和4．18±1．10，P〈0．05。B基因型HBV感染者的血清白蛋白（ALB）水平（39．6±9．6g／l）显著高于C基因型（30．1±7．3g／l），P〈0．05。结论PCR微板核酸杂交-ELISA技术可用于HBV基因型的临床检测。镇江地区HBV感染者基因型以单一的B型或C型为主．含少量B＋C型。C基因型为本地区优势基因型。并在严重肝病和原发性肝癌中比例较高，其引起的ALT、TBIL、病毒血症水平均较高，HBeAg血症持续时间长，故预后较差。

简介：摘要目的分析泉州2018—2019年人呼吸道合胞病毒（HRSV）流行情况和基因特征。方法样本来自2018年11月至2019年5月福建省泉州市儿童医院送检的下呼吸道感染患儿咽拭子样本，共141份。采用RT-PCR法进行HRSVG基因3′末端靶基因扩增，使用sequencher 5.0以及MEGA5.05软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析。结果HRSV阳性样本25份，17份样本成功获得靶基因序列，其中HRSVA 13份，HRSVB 4份；共鉴定出两个基因型：ON1基因型（13份，HRSVA）和BA9基因型（4份，HRSVB）。5条ON1基因型靶基因序列与2012—2015年北京、长春和浙江流行的ON1基因型序列汇聚为一簇（Cluster1）；1条（FJ19-02）与2012—2015年我国多个地区流行的ON1基因型序列汇聚为一簇（Cluster2）；其余7条为独立的一簇（Cluster-FJ）。HRSVB亚型中FJ18-02、FJ19-14、FJ19-15与2015年在吉林长春流行的BA9基因型序列汇聚在一起；FJ19-13则与2013年在广州和浙江两地流行的BA9基因型序列具有较近的亲缘性。ON1基因型和BA9基因型均在重复插入的72和60个碱基片段区出现了核苷酸和氨基酸变异。Cluster-FJ分支靶基因序列出现了特征性氨基酸突变（H266L）；FJ19-13出现了H261Q和Q265L的独立突变。结论2018—2019年福建泉州流行的HRSV基因型为BA9和ON1，Cluster-FJ为新发现的独立传播链，有可能在泉州建立了本土循环流行。

简介：目的了解山西省乙型肝炎病毒(HBV)基因型流行病学分布特征,并分析不同基因型与HBV感染谱的相关性.方法用S基因巢式聚合酶链反应-限制片段长度多态性(PCR-RFLP)的基因型分型方法,对44例携带者、70例慢性乙型肝炎、34例慢性重症乙型肝炎、29例肝硬化患者感染的HBV进行分型,并分析了不同感染谱中HBV基因型的分布.结果①177例感染者HBV基因型C型130例(73.5%)和B型43例(24.3%),偶见D型1例(0.6%),未定型3例(1.7%).②各种乙型肝炎患者的HBV基因型以C型为主,HBV携带者的基因型主要为B基因型.结论山西省乙型肝炎病毒感染者以C型和B型为优势基因型,与我国北方地区HBV基因型分布相似,但亦有少数其他基因型存在.HBV基因型C可能是乙型肝炎病情进展的相关因素.

简介：摘要目的研究赤峰市及周边地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型的流行病学特点。方法采用INNOLIPA反向线形探针杂交法,对来自赤峰市及周别地区719例慢性丙型肝炎患者进行了HCV基因型调查。结果719例患者中丙肝基因型分布如下1b型359例，2a型347例，2i型6例，3a型2例，3b型2例，1a型2例，2r型1例。结论静脉药瘾或毒品注射是赤峰市及周边地区丙型肝炎的重要传播途径。

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简介：摘要诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一，极易突变和重组，型别众多。研究早期采用VP1区氨基酸序列对诺如病毒进行分型及鉴定。由于处在或接近聚合酶和衣壳区的重叠区为重组发生的热点区域，因此国际上提出使用聚合酶和衣壳区的双区域分型系统。目前基于2 s标准的双区域分型方法，聚合酶区可分为10个基因组及76种基因型，包括2个暂定基因组及16种暂定基因型，VP1可分为12个基因组及53种基因型，包括2个暂定基因组及5种暂定基因型。暂定基因组和基因型有待进一步型别鉴定和基因组划分。本文对诺如病毒分子特征、不同分型方法的原理、序列扩增方法、在线分型工具及最新的基因分型研究进展进行综述。

简介：摘要目的分析2017年山东省戊型肝炎病毒（HEV）的基因型分布和分子流行病学特征。方法选取山东省2017年1—12月通过国家法定传染病报告系统报告的戊型肝炎病例为研究对象，对其进行个案调查，并采集其血清标本，共1 045例。采用酶联免疫吸附试验（ELISA）法复核检测HEV-IgM和HEV-IgG抗体，对HEV-IgM阳性者的血清提取病毒核酸，采用逆转录PCR方法扩增HEV开放式阅读框架2区域内长度为644 bp的核苷酸片段，直接测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行同源性和系统进化分析。结果HEV-IgM复核检测阳性者638例（61.1%），其中男性病例年龄为（57.9±12.2）岁，阳性率为61.5%（496/807），女性病例年龄为（58.1±15.0）岁，阳性率为59.7%（142/238）；复核检测阳性者中共检出163株HEV毒株，检出率为25.6%（163/638），其中，东、中和西部地区检出率分别为23.0%（71/309）、33.6%（72/214）和17.4% (20/115)。检出的163株HEV病毒株均属于基因Ⅳ型，以4d亚型为主，占85.9%（140株），其次为4b亚型（7.4%，12株），以及少量的4a和4h亚型，分别占3.7%（6株）和3.1%（5株）。4a、4b和4h基因亚型组病例以东部为主，分别占3/5、11/12和4/6；4d基因亚型组以中部为主，占50.0%（70/140）。163株HEV的核苷酸序列同源性为82.7%~100.0%，其中140株HEV 4d亚型毒株与山东省猪源（KF176351）、牛源（KU904278）和羊源（KU904267）HEV毒株亲缘关系较近，核苷酸同源性分别为93.1%～98.3%、92.7%～97.9%和92.7%～97.9%。结论山东省HEV优势流行株属于基因Ⅳ型4d亚型，跨种间传播可能是山东省人HEV感染的主要来源。

简介：

简介：摘要目的通过对74例丙型肝炎病毒（HCV）基因分型实验室检测结果并结合临床资料进行分析，探讨HCV基因分型的临床应用价值。方法收集我院住院患者抗-HCV和丙型肝炎病毒RNA核酸定量均为阳性的标本，采用丙型肝炎基因分型特异性引物及荧光探针，应用一步法聚合酶链式反应（RT-PCR）结合Taqman技术对HCV进行Ⅰ型和非Ⅰ型的荧光PCR分型检测。结果检测74例标本共检出两种基因型，分别为Ⅰ型基因30例，非Ⅰ型基因44例；74例感染者有输血者40例。结论74例感染者各基因型男女感染的比例差异无统计学意义，通过输血感染丙型肝炎病毒无性别差异。综合分析，HCV基因分型对丙型肝炎的预防、诊断、治疗、个体化用药以及愈后评估都具有重要意义。