简介：壳聚糖酶是制备低聚壳聚糖的关键酶。本研究对已报道可培养微生物的壳聚糖酶序列特征进行分析,筛选出海洋宏基因组测序数据中的新假定壳聚糖酶。应用结构模建和分子对接的方法探讨假定壳聚糖酶的催化机制。结果表明：1）已报道的214个已知壳聚糖酶主要分布在GH46（201）,GH8（7）,GH75（3）,GH5（2）和GH3（1）家族。氨基酸长度、分子质量和等电点分别集中于200-400aa,20-40ku和4.0-7.0;2）从海洋宏基因组测序数据中共获得237个假定壳聚糖酶,分布在GH8（13）,GH46（27）,GH5（85）,GH3（100）,GH18（3）,GH25（2）,GH10（1）,GH30（1）,GH35（2）,GH42（1）,GH77（1）,GH16（1）家族。这些新酶序列与已知壳聚糖酶相似度低,其一级结构关键区域保守,结构域、氨基酸长度、分子质量和等电点与已知壳聚糖酶相似;3）应用I-TASSER对来源于4个不同家族的蛋白序列进行结构模建,发现与已知壳聚糖酶的结构相似,用autodock与壳寡糖进行分子对接,从理论上验证了海洋宏基因组新壳聚糖酶的功能。
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