简介：摘要自2008年手足口病（hand，foot，and mouth disease，HFMD）纳入国家法定传染病管理以来，引起HFMD的优势病原有所改变。2012年以后由柯萨奇病毒A组10型（coxsackie virus A10，CV-A10）引起的HFMD发病率处于较高水平。本文就CV-A10病原学特征及其所致HFMD流行情况等展开综述，为HFMD防控策略制定提供依据。

简介：摘要目的了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本，荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组，采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别，利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性，占19%（23/142）；119份为GII阳性，占81%（119/142）。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型，包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示：GI.1[P1]型安徽株与韩国株（MZ021974）、法国株（MK956173）同属一个进化分支；GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株（MN922742）、四川株（MW255366）、韩国株（MZ022026）进化距离较近；GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株（MN938461）、2021年广东株（OK562729）处于一个进化分支；GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇，与陕西株（MW243609）、日本株（LC646339）进化距离较近。结论安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性，有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。

简介：摘要目的了解安徽省2020年柯萨奇A组10型（coxsackievirus A10，CV-A10）流行特征及VP1区基因特征。方法选取2020年1月至12月安徽省各市疾控中心上送的手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）标本，接种人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离培养，采用荧光定量RT-PCR鉴定病毒分离物，对CV-A10毒株进行RT-PCR VP1区扩增及序列测定，使用软件对测序结果进行分析并构建系统进化树。结果共分离HFMD标本186份，阳性标本147株，其中CV-A10分离株13株，占8.84%（13/147），柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16，CV-A16）分离株4株，占2.72%（4/147），柯萨奇病毒A组6型（coxsackievirus A6，CV-A6）分离株130株，占88.44%（130/147），未分离到肠道病毒A组71型（enterovirusA71，EV-A71），总病毒分离率为79.03%。将13株CV-A10毒株进行VP1区全长扩增，共获得6条完整VP1序列。本研究中CV-A10毒株VP1区核苷酸同源性为97.9%~100.0%，氨基酸同源性为99.0%~100.0%；与CV-A10原型株（Kowalik）VP1区核苷酸同源性为76.3%~76.6%，氨基酸同源性为92.3%~100.0%。系统进化分析显示CV-A10可划分为分为A~I 9个基因型，2020年安徽省6株CV-A10均属于C基因型。结论2020年安徽省CV-A10毒株属于C基因型，为优势流行基因型，与国内其他地区毒株共进化。

简介：摘要目的对安徽省新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例标本进行新型冠状病毒核酸检测，分析各类标本检出情况，为病例确诊及判断样本带毒风险提供依据。方法采用实时荧光RT-PCR方法检测197病例466份临床标本，病毒靶基因为ORF1ab和N，应用卡方检验探讨不同标本在不同临床分型和发病时间核酸阳性率差异。结果COVID-19病例痰液标本在各临床标本中阳性率最高94.67%(160/169)，其次为咽拭子88.83%(159/179)，血清6.78%(4/59)，全血标本阳性率较低，为5.08%(3/59)。发病0～7 d普通型患者咽拭子阳性率和痰液阳性检出率差异有统计学意义(χ2＝8.994，P＝0.003)。结论痰液标本核酸阳性检出率高于咽拭子标本，COVID-19病例血液标本存在病毒核酸，存在感染风险。

简介：摘要目的确定1例由孟加拉国输入芜湖的登革热病例及登革病毒(dengue virus, DENV)的E基因分子特征。方法提取患者血清标本核酸，使用Real-time RT-PCR方法进行DENV核酸通用及1/2/3/4血清型筛查。测定E基因完整序列，采用MEGA7.0软件构建E基因系统进化树，并进行E基因核苷酸和氨基酸序列比对分析。结果患者血清呈现2型DENV核酸阳性。E基因序列系统进化分析显示属于Cosmopolitan基因型，与2014年马来西亚输入中国台湾分离株(D2/Malaysia/1408aTw)同源性最高，核苷酸同源性为99.60%，氨基酸同源性为99.80%，有6处核苷酸差异(42：G→A; 141：G→A; 490：G→A; 516：A→G; 954：A→G; 1344：C→T)，1处氨基酸差异(164：V→I)。E蛋白拥有弱毒株特征位点E126-E和强毒株特征位点E383～385-E-P-G。结论输入型患者为2型DENV感染且该病毒起源于马来西亚。