Illumina MiSeq高通量测序分析花生仁内生细菌多样性-中国期刊网

摘要为了调查花生仁内生细菌种类多样性,应用IlluminaMiSeq高通量测序技术测定花生仁内生细菌的16SrDNA-V4变异区序列,并采用Mothur软件整理及统计样品序列数目和操作分类单元（OTUs）数量,分析物种的丰度、分布和α多样性.研究获得用于分析的有效序列和OTU数分别为69284和25;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和.花生仁内生细菌主要分布于食酸菌属（Acidovorax）和希瓦氏菌属（Shewanella）,丰度分别为83.33%和16.67%.且内生细菌的Chao1指数为25.00,Shannon指数为1.29.

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